27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2207 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  100 
 
 
458 aa  936  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  44.1 
 
 
432 aa  329  8e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  5.34788e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0715  outer membrane porin  40.21 
 
 
451 aa  294  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3627  outer membrane porin  37.42 
 
 
435 aa  270  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  36.78 
 
 
402 aa  177  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  33.52 
 
 
403 aa  157  5e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  5.02534e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0474  outer membrane porin  37.03 
 
 
407 aa  143  8e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  4.58474e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2087  outer membrane porin  30.98 
 
 
452 aa  139  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0734  outer membrane porin  29.64 
 
 
384 aa  110  4e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0265  hypothetical protein  31.62 
 
 
493 aa  91.3  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  2.73485e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4147  outer membrane porin  26.91 
 
 
407 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.17719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0255  outer membrane porin  24.29 
 
 
406 aa  70.1  7e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4293  outer membrane porin  24.27 
 
 
398 aa  69.7  1e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0195017  normal  0.981008 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1540  outer membrane porin  28.42 
 
 
456 aa  62  2e-08  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000339272  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1456  hypothetical protein  25.82 
 
 
450 aa  59.7  1e-07  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1215  outer membrane porin  25.71 
 
 
442 aa  52.8  1e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  3.87662e-06  hitchhiker  1.48872e-08 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1497  hypothetical protein  25.71 
 
 
442 aa  52.8  1e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0123  major outer membrane protein  29.03 
 
 
405 aa  49.7  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0135  hypothetical protein  25.1 
 
 
388 aa  49.7  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.881577  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0307  hypothetical protein  26.92 
 
 
280 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  2.84732e-05  decreased coverage  6.57786e-06 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0137  hypothetical protein  26.92 
 
 
447 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1459  hydrogenase-4 component I  29.71 
 
 
402 aa  46.2  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1917  hypothetical protein  22.17 
 
 
423 aa  44.7  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.50266  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0258  outer membrane porin  24.19 
 
 
442 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103273  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0814  outer membrane porin  21.51 
 
 
471 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657196  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2788  outer membrane porin  22.49 
 
 
413 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0195  major outer membrane protein  29.07 
 
 
414 aa  43.5  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.672535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>