13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0829 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0829  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  927    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000679241  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0802  hypothetical protein  33.05 
 
 
473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00695722  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  29.85 
 
 
558 aa  57  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  24.84 
 
 
551 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  23.39 
 
 
545 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  28.36 
 
 
550 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  25 
 
 
551 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  22.62 
 
 
492 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  23.91 
 
 
551 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  29.5 
 
 
552 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  27.52 
 
 
552 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  28.97 
 
 
551 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  21.8 
 
 
538 aa  43.9  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>