More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_2109 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 
586 aa  706    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 
589 aa  665    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 
589 aa  660    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 
585 aa  649    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 
592 aa  646    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 
588 aa  649    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 
586 aa  684    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  99.83 
 
 
586 aa  1214    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 
611 aa  640    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
592 aa  1229    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 
584 aa  627  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 
587 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
587 aa  589  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
598 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
609 aa  572  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
609 aa  571  1e-161  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1946  arginyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
609 aa  567  1e-160  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
579 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 
587 aa  566  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
579 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
554 aa  518  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
554 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
561 aa  511  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
561 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 
554 aa  498  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
563 aa  496  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
559 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
570 aa  492  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
556 aa  487  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
561 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
562 aa  479  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
559 aa  479  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
556 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
561 aa  475  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 
551 aa  474  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
557 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
564 aa  465  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
551 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
559 aa  462  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
556 aa  458  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  44 
 
 
551 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
556 aa  458  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
562 aa  458  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
562 aa  458  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
551 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
568 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
556 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
550 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
556 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
562 aa  455  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
575 aa  454  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
556 aa  449  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
561 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
560 aa  452  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 
564 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
562 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
550 aa  443  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
551 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 
564 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
553 aa  438  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
594 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
594 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
569 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
594 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
556 aa  428  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
594 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
546 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
553 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
594 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 
556 aa  428  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
594 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
556 aa  428  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
553 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
594 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1654  arginyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
549 aa  422  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0671403  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
546 aa  424  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
563 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
561 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
594 aa  422  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 
564 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 
557 aa  415  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
564 aa  415  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 
553 aa  413  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0385  arginyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 
598 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603012  normal  0.077689 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 
594 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
542 aa  414  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1680  arginyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
585 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21246  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
598 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1482  arginyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
585 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747678  normal  0.431119 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2831  arginyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
593 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2968  arginyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
593 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2487  arginyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.619732  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>