More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0059 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0059  putative oxidoreductase  100 
 
 		 349 aa  708    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3878  oxidoreductase domain protein  94.27 
 
 		 349 aa  623  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  78.39 
 
 		 349 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  69.16 
 
 		 350 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  69.16 
 
 		 350 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  69.16 
 
 		 350 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2998  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  69.16 
 
 		 350 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3306  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  69.16 
 
 		 367 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1539  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  69.16 
 
 		 350 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3064  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  69.16 
 
 		 367 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3923  oxidoreductase YdgJ  69.16 
 
 		 350 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440604  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3327  oxidoreductase-like  69.16 
 
 		 350 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0135  oxidoreductase domain-containing protein  68.3 
 
 		 350 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2907  oxidoreductase-like  68.01 
 
 		 350 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0145  oxidoreductase domain-containing protein  70.89 
 
 		 350 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550322  normal  0.534197 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0148  oxidoreductase domain-containing protein  68.01 
 
 		 350 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0161  oxidoreductase domain-containing protein  68.34 
 
 		 341 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0147  oxidoreductase domain-containing protein  68.05 
 
 		 341 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  49.26 
 
 		 348 aa  325  8.000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  49.26 
 
 		 348 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  47.67 
 
 		 346 aa  320  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  47.21 
 
 		 350 aa  320  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  47.13 
 
 		 350 aa  314  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  47.04 
 
 		 346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  46.76 
 
 		 349 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  46.15 
 
 		 346 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1257  oxidoreductase domain-containing protein  46.65 
 
 		 348 aa  311  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1765  oxidoreductase domain-containing protein  49.28 
 
 		 345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375729  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  45.86 
 
 		 346 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  45.86 
 
 		 346 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  45.86 
 
 		 346 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  45.8 
 
 		 349 aa  309  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  45.8 
 
 		 349 aa  309  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  45.8 
 
 		 349 aa  309  5e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  46.47 
 
 		 349 aa  308  9e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1748  oxidoreductase domain-containing protein  48.38 
 
 		 346 aa  306  3e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  45.27 
 
 		 346 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  47.34 
 
 		 346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  47.34 
 
 		 346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  47.34 
 
 		 359 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  47.34 
 
 		 346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  47.34 
 
 		 346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  47.34 
 
 		 359 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  48.55 
 
 		 357 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  47.04 
 
 		 359 aa  302  7.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  46.75 
 
 		 346 aa  300  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.48 
 
 		 346 aa  299  5e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  42.81 
 
 		 343 aa  294  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  41.02 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  41.02 
 
 		 343 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.92 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.92 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.92 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  41.92 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.92 
 
 		 343 aa  285  8e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  42.44 
 
 		 346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  43.49 
 
 		 346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  41.32 
 
 		 343 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.32 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  46.36 
 
 		 360 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  45.32 
 
 		 336 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  40.12 
 
 		 342 aa  275  6e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  42.94 
 
 		 374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02398  oxidoreductase protein  46.13 
 
 		 383 aa  270  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.446825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  44.99 
 
 		 361 aa  269  5.9999999999999995e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  41.72 
 
 		 346 aa  268  8e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  44.9 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  44.9 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1123  oxidoreductase domain-containing protein  44.64 
 
 		 349 aa  262  8e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  46.61 
 
 		 376 aa  260  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  40.88 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  37.57 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2007  oxidoreductase  39.76 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0414834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  38.08 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3437  oxidoreductase domain protein  40.12 
 
 		 347 aa  239  5.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0473864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  42.49 
 
 		 350 aa  238  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  38.84 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6869  oxidoreductase YdgJ  43.24 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1166  oxidoreductase domain-containing protein  39.64 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  36.13 
 
 		 355 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  40.12 
 
 		 353 aa  226  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  40.7 
 
 		 357 aa  222  8e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  35.07 
 
 		 360 aa  221  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  35.5 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0451  oxidoreductase domain protein  40.23 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6241  oxidoreductase domain protein  41.47 
 
 		 332 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3848  putative dehydrogenase  34.4 
 
 		 345 aa  212  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.936514 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  37.75 
 
 		 358 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3914  putative dehydrogenase  33.53 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.465022 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3734  putative dehydrogenase  34.31 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3854  putative dehydrogenase  33.53 
 
 		 345 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3812  putative dehydrogenase  33.43 
 
 		 345 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3745  putative dehydrogenase  33.53 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4013  oxidoreductase domain-containing protein  39.42 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3724  putative dehydrogenase  35.09 
 
 		 345 aa  206  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3413  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  35.82 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0020549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1832  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  35.22 
 
 		 353 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000457819  normal  0.338324 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03291  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  34.8 
 
 		 345 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3918  putative dehydrogenase  34.8 
 
 		 345 aa  202  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>