More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2865 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
462 aa  954  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  81.16 
 
 
463 aa  785  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1623  cysteinyl-tRNA synthetase  80.83 
 
 
458 aa  753  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2507  cysteinyl-tRNA synthetase  78.48 
 
 
461 aa  735  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3090  cysteinyl-tRNA synthetase  79.96 
 
 
459 aa  750  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1349  cysteinyl-tRNA synthetase  82.65 
 
 
470 aa  779  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4936  cysteinyl-tRNA synthetase  76.79 
 
 
460 aa  672  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1670  cysteinyl-tRNA synthetase  72.05 
 
 
457 aa  691  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2091  cysteinyl-tRNA synthetase  80.39 
 
 
458 aa  735  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  68.56 
 
 
462 aa  646  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2456  cysteinyl-tRNA synthetase  70.56 
 
 
474 aa  667  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2320  cysteinyl-tRNA synthetase  78.7 
 
 
459 aa  701  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0745379  hitchhiker  9.6837e-05 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0919  cysteinyl-tRNA synthetase  68.85 
 
 
456 aa  634  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2510  cysteinyl-tRNA synthetase  66.88 
 
 
465 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390951  hitchhiker  0.00182498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1008  cysteinyl-tRNA synthetase  67.17 
 
 
463 aa  628  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0156033  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1102  cysteinyl-tRNA synthetase  66.96 
 
 
463 aa  627  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1390  cysteinyl-tRNA synthetase  68.18 
 
 
465 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128529  normal  0.023176 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1941  cysteinyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
465 aa  621  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5999  cysteinyl-tRNA synthetase  67.32 
 
 
465 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2078  cysteinyl-tRNA synthetase  67.32 
 
 
465 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1085  cysteinyl-tRNA synthetase  66.01 
 
 
491 aa  615  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189428  normal  0.0293604 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5384  cysteinyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
465 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.706062  normal  0.64461 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2097  cysteinyl-tRNA synthetase  67.1 
 
 
465 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.466573  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3046  cysteinyl-tRNA synthetase  69.85 
 
 
461 aa  612  1e-174  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1626  cysteinyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
465 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2113  cysteinyl-tRNA synthetase  66.02 
 
 
465 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1167  cysteinyl-tRNA synthetase  66.23 
 
 
465 aa  608  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103302  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  64.85 
 
 
455 aa  605  1e-172  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1983  cysteinyl-tRNA synthetase  66.02 
 
 
465 aa  606  1e-172  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746601  normal  0.57879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1203  cysteinyl-tRNA synthetase  66.23 
 
 
465 aa  607  1e-172  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0892832  normal  0.183053 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2681  cysteinyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 
465 aa  607  1e-172  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2545  cysteinyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 
465 aa  607  1e-172  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1656  cysteinyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 
465 aa  607  1e-172  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000728192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3156  cysteinyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 
465 aa  607  1e-172  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.719949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1432  cysteinyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 
465 aa  607  1e-172  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2596  cysteinyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 
465 aa  607  1e-172  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0629177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2159  cysteinyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 
465 aa  607  1e-172  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0858  cysteinyl-tRNA synthetase  61.57 
 
 
473 aa  594  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  64.72 
 
 
454 aa  589  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  60.51 
 
 
473 aa  583  1e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.969575  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  62.04 
 
 
464 aa  583  1e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  61.97 
 
 
465 aa  575  1e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  62.28 
 
 
460 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 
461 aa  521  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  3.07026e-05 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  57.05 
 
 
461 aa  522  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 
485 aa  524  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  56.87 
 
 
460 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 
456 aa  520  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  56.87 
 
 
460 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  56.65 
 
 
460 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  56.87 
 
 
460 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  54.3 
 
 
485 aa  517  1e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 
460 aa  517  1e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  4.55216e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 
460 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 
459 aa  507  1e-142  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 
461 aa  505  1e-142  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  5.65226e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  55.79 
 
 
460 aa  505  1e-142  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  55.79 
 
 
460 aa  505  1e-142  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 
460 aa  505  1e-142  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 
461 aa  505  1e-142  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.39481e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 
460 aa  505  1e-142  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 
461 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  53.43 
 
 
460 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 
461 aa  501  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 
505 aa  498  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  54.41 
 
 
461 aa  498  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 
461 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 
454 aa  500  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 
488 aa  496  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  52.7 
 
 
459 aa  497  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.26973e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  54.41 
 
 
463 aa  495  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 
459 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.79239e-08  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 
459 aa  497  1e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 
459 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.05927e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 
459 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  54.41 
 
 
461 aa  495  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 
461 aa  494  1e-138  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  4.06523e-06  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 
459 aa  493  1e-138  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.05095e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
462 aa  491  1e-138  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 
459 aa  494  1e-138  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.84367e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 
461 aa  493  1e-138  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 
459 aa  493  1e-138  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 
488 aa  491  1e-138  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 
459 aa  491  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  7.06228e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 
461 aa  491  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 
459 aa  491  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 
456 aa  491  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 
469 aa  488  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 
461 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  9.73737e-07  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 
461 aa  491  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.64638e-05  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 
459 aa  488  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.69576e-05  decreased coverage  4.05781e-07 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 
461 aa  485  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 
461 aa  485  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.2906e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  53.39 
 
 
456 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  54.84 
 
 
461 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
461 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
461 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
461 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
461 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 
461 aa  482  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  8.69328e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>