47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2462 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  100 
 
 		 199 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  39.55 
 
 		 182 aa  126  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  37.57 
 
 		 202 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  36.63 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3745  putative transmembrane protein  39.02 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  33.57 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  36.42 
 
 		 188 aa  98.2  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1551  hypothetical protein  32.45 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  37.88 
 
 		 146 aa  92.8  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  34.21 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0901  putative transmembrane protein  35.33 
 
 		 178 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0767133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  31.45 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4601  putative transmembrane protein  35.15 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0346452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4467  putative transmembrane protein  35.15 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00546453  normal  0.335651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  25.9 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0778  putative transmembrane protein  32.41 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  27.59 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  26.85 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  30.77 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  30 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  28.19 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3849  hypothetical protein  28.74 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125049  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01895  putative transmembrane protein  32.57 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0216755  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  30.85 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1282  hypothetical protein  26.63 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4669  hypothetical protein  25.74 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865446 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5256  hypothetical protein  27.94 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.631222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0643  hypothetical protein  27.41 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817874  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4957  hypothetical protein  29.2 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49880  hypothetical protein  26.55 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0691  hypothetical protein  26.26 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4248  hypothetical protein  27.68 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4437  hypothetical protein  26.29 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000924263 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4671  hypothetical protein  24.38 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3616  hypothetical protein  26.28 
 
 		 236 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3339  hypothetical protein  28.15 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5028  hypothetical protein  28.15 
 
 		 265 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.966496  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05846  hypothetical protein  25.85 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3632  hypothetical protein  20.11 
 
 		 177 aa  48.5  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3615  hypothetical protein  24.44 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0819  hypothetical protein  24.44 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3486  hypothetical protein  24.44 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515879  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0674  hypothetical protein  22.22 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal  0.849594 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3832  hypothetical protein  23.38 
 
 		 183 aa  45.1  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0768  hypothetical protein  22.92 
 
 		 176 aa  44.7  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5029  putative transmembrane protein  27.41 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.313273  normal  0.903322 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0239  hypothetical protein  23.48 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>