23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4747 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4747  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  696    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3735  hypothetical protein  60.82 
 
 
338 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324611  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2891  hypothetical protein  38.52 
 
 
282 aa  202  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5388  hypothetical protein  36.56 
 
 
300 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.293041  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29950  hypothetical protein  37.81 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1344  hypothetical protein  31.25 
 
 
284 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168179  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1358  glycosyltransferase  35.16 
 
 
296 aa  157  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1356  glycosyltransferase  31.53 
 
 
301 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1205  glycosyltransferase  33.09 
 
 
303 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5064  hypothetical protein  35.14 
 
 
286 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1199  glycosyltransferase  33.58 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1198  hypothetical protein  33.71 
 
 
295 aa  129  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2519  putative glycosyltransferase  33.07 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1499  glycosyltransferase  31.45 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4208  hypothetical protein  29.15 
 
 
308 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000811212  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0241  hypothetical protein  30.69 
 
 
299 aa  105  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1480  hypothetical protein  33.09 
 
 
281 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357744  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4523  hypothetical protein  32.93 
 
 
260 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0674  hypothetical protein  23.87 
 
 
304 aa  79  0.0000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.130919  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0114  hypothetical protein  24.7 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3013  hypothetical protein  29.8 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3065  hypothetical protein  31.9 
 
 
563 aa  46.2  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177227  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00840  hypothetical protein  25.87 
 
 
423 aa  44.3  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>