20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6545 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6545  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  653    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0030  hypothetical protein  27.68 
 
 
628 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  25.16 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  25.48 
 
 
638 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  25.48 
 
 
638 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  25.48 
 
 
638 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  25.48 
 
 
638 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0018  hypothetical protein  26.13 
 
 
605 aa  59.7  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1857  hypothetical protein  27.27 
 
 
504 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5216  hypothetical protein  24.5 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3152  hypothetical protein  24.5 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3363  hypothetical protein  25.75 
 
 
329 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  27.89 
 
 
342 aa  52.8  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4722  hypothetical protein  43.08 
 
 
694 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224738  normal  0.0942649 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  28.84 
 
 
569 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  32.05 
 
 
410 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  27.63 
 
 
410 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2983  hypothetical protein  29.3 
 
 
167 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2265  hypothetical protein  23.93 
 
 
852 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  32.47 
 
 
397 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>