47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2642 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2613  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  98.3 
 
 
235 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2003  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  98.3 
 
 
235 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210005  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5944  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  90.64 
 
 
235 aa  431  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.163492 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2660  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  88.46 
 
 
235 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2533  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  87.61 
 
 
235 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0856  carbon monoxide dehydrogenase family protein  71.07 
 
 
242 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0851  carbon monoxide dehydrogenase family protein  71.07 
 
 
242 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2442  carbon monoxide dehydrogenase family protein  71.07 
 
 
242 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0608  carbon monoxide dehydrogenase family protein  71.07 
 
 
242 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.802203  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0056  carbon monoxide dehydrogenase family protein  71.07 
 
 
242 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1016  hypothetical protein  71.07 
 
 
242 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0678  hypothetical protein  70.66 
 
 
242 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0685  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  76.17 
 
 
235 aa  318  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.31708 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58.47 
 
 
248 aa  279  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  57.94 
 
 
253 aa  270  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  55.95 
 
 
253 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.67 
 
 
193 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.82 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.41 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.33 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  29.27 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  28.38 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.8 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.8 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.25 
 
 
243 aa  62.4  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.34 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.07 
 
 
204 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  25.16 
 
 
161 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.5 
 
 
154 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.5 
 
 
154 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 
156 aa  52.4  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.32 
 
 
178 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.78 
 
 
216 aa  52  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.4 
 
 
176 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.67 
 
 
202 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  26.97 
 
 
176 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.81 
 
 
148 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.03 
 
 
148 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.79 
 
 
197 aa  48.5  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  25.17 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  24.48 
 
 
150 aa  46.6  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.12 
 
 
147 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  26.47 
 
 
148 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.38 
 
 
152 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.17 
 
 
151 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  28.68 
 
 
983 aa  42.4  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>