More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2481 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2393  transcriptional regulator CysB-like protein  99.36 
 
 
313 aa  634  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
313 aa  638  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2476  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
313 aa  638  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14516  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2525  transcriptional regulator CysB-like protein  99.36 
 
 
313 aa  634  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2481  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
313 aa  638  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5807  transcriptional regulator CysB-like protein  99.04 
 
 
313 aa  633  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0818  transcriptional regulator CysB-like protein  98.4 
 
 
313 aa  631  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2349  transcriptional regulator CysB-like protein  94.89 
 
 
313 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1005  transcriptional regulator CysB-like protein  94.89 
 
 
313 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1012  transcriptional regulator CysB-like protein  94.89 
 
 
313 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0662  transcriptional regulator CysB-like protein  94.89 
 
 
313 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2936  transcriptional regulator CysB-like protein  94.89 
 
 
313 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1165  transcriptional regulator CysB-like protein  94.89 
 
 
313 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1663  transcriptional regulator CysB-like protein  94.89 
 
 
313 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0813  transcriptional regulator CysB-like protein  94.25 
 
 
313 aa  608  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0969  transcriptional regulator CysB-like protein  90.73 
 
 
313 aa  584  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  91.69 
 
 
313 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3665  transcriptional regulator CysB-like protein  90.73 
 
 
313 aa  583  1e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.891363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2818  transcriptional regulator CysB-like protein  77 
 
 
313 aa  505  1e-142  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2427  transcriptional regulator CysB-like protein  74.76 
 
 
313 aa  498  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2698  transcriptional regulator CysB-like protein  74.76 
 
 
313 aa  495  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2231  transcriptional regulator CysB-like protein  74.12 
 
 
313 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2691  transcriptional regulator CysB-like protein  74.76 
 
 
313 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644017  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0620  transcriptional regulator CysB-like protein  68.05 
 
 
313 aa  462  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0418657  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2726  transcriptional regulator CysB-like protein  59.42 
 
 
313 aa  399  1e-110  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.634553  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4926  transcriptional regulator CysB-like protein  58.79 
 
 
313 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1946  transcriptional regulator CysB-like protein  58.36 
 
 
317 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.226921  normal  0.0811949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3535  transcriptional regulator CysB-like protein  58.15 
 
 
326 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3166  transcriptional regulator CysB-like protein  58.15 
 
 
313 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0200207  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2404  transcriptional regulator CysB-like protein  58.6 
 
 
314 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.044463  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1721  transcriptional regulator CysB-like protein  57.83 
 
 
313 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1917  transcriptional regulator CysB-like protein  57.83 
 
 
313 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2173  transcriptional regulator CysB-like protein  57.96 
 
 
314 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1501  transcriptional regulator CysB-like protein  55.41 
 
 
308 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2599  transcriptional regulator CysB-like protein  57.32 
 
 
321 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  57.84 
 
 
311 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1521  transcriptional regulator CysB-like protein  55.41 
 
 
308 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1632  transcriptional regulator CysB-like protein  55.41 
 
 
308 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2476  transcriptional regulator CysB-like protein  55.08 
 
 
308 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1582  transcriptional regulator CysB-like protein  54.75 
 
 
308 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3810  LysR family transcriptional regulator  55.52 
 
 
312 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1125  transcriptional regulator CysB-like protein  54.43 
 
 
308 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4743  transcriptional regulator CysB-like protein  54.75 
 
 
308 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217696  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0810  transcriptional regulator CysB-like protein  54.75 
 
 
308 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259681  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2018  transcriptional regulator CysB-like protein  54.75 
 
 
308 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1205  transcriptional regulator CysB-like protein  54.75 
 
 
308 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.215298  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  54.75 
 
 
308 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1605  transcriptional regulator CysB-like protein  54.75 
 
 
308 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339549  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1851  transcriptional regulator CysB-like protein  54.75 
 
 
308 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0350  transcriptional regulator CysB-like protein  54.75 
 
 
308 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0871745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1694  transcriptional regulator CysB-like protein  54.75 
 
 
308 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272702  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2466  transcriptional regulator CysB-like protein  54.43 
 
 
308 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1777  transcriptional regulator CysB-like protein  54.43 
 
 
308 aa  364  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16529  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  54.58 
 
 
313 aa  361  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1625  transcriptional regulator CysB-like protein  53.57 
 
 
308 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879627  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  53.59 
 
 
354 aa  357  1e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2129  transcriptional regulator CysB-like protein  54.22 
 
 
311 aa  355  5e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.74673e-16  decreased coverage  1.24662e-06 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2112  transcriptional regulator CysB-like protein  57.73 
 
 
317 aa  355  7e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  54.61 
 
 
308 aa  351  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 
312 aa  349  4e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  51.12 
 
 
320 aa  346  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  51.12 
 
 
320 aa  346  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2910  transcriptional regulator CysB-like protein  50.8 
 
 
313 aa  346  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0071  LysR family transcriptional regulator  56.86 
 
 
314 aa  345  6e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16172  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1296  transcriptional regulator, LysR family  50.8 
 
 
320 aa  344  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0621  transcriptional regulator CysB-like protein  51.62 
 
 
309 aa  343  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0061  transcriptional regulator, LysR family  54.29 
 
 
314 aa  342  6e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1739  transcriptional regulator CysB-like protein  50.97 
 
 
314 aa  337  2e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  2.79611e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3039  LysR family transcriptional regulator  54.9 
 
 
309 aa  336  4e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.0769631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1967  transcriptional regulator CysB-like protein  52.9 
 
 
315 aa  335  8e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1287  transcriptional regulator CysB-like protein  51.97 
 
 
319 aa  332  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767639  normal  0.313196 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1379  transcriptional regulator CysB-like protein  51.95 
 
 
316 aa  332  7e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1224  transcriptional regulator CysB-like protein  51.64 
 
 
319 aa  331  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178615  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1348  transcriptional regulator CysB-like protein  51.32 
 
 
327 aa  328  9e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  50 
 
 
306 aa  328  9e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1697  transcriptional regulator CysB  48.52 
 
 
326 aa  325  5e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.828749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0963  LysR family transcriptional regulator  49.68 
 
 
308 aa  320  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377381  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0341  transcriptional regulator CysB  46.73 
 
 
333 aa  311  7e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1658  transcriptional regulator Cbl  45.95 
 
 
316 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  7.65107e-08  normal  0.0208007 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1324  transcriptional regulator CysB  46.71 
 
 
324 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2831  transcriptional regulator Cbl  45.63 
 
 
316 aa  298  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.01541e-08  normal  0.682702 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  45.39 
 
 
323 aa  298  8e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003883  regulatory protein CysB  45.08 
 
 
324 aa  298  8e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.803514  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1979  transcriptional regulator CysB  45.08 
 
 
323 aa  297  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2649  transcriptional regulator CysB  45.07 
 
 
324 aa  296  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1624  transcriptional regulator CysB  44.08 
 
 
324 aa  296  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.483368  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1731  transcriptional regulator CysB  45.07 
 
 
324 aa  295  6e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00171097  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1587  transcriptional regulator CysB  45.07 
 
 
324 aa  295  6e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296126  normal  0.104148 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1662  transcriptional regulator CysB  45.07 
 
 
324 aa  295  6e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0319237  unclonable  1.81404e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1137  transcriptional regulator Cbl  45.95 
 
 
316 aa  295  8e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.42733e-08  hitchhiker  5.52963e-05 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01897  DNA-binding transcriptional activator of cysteine biosynthesis  45.95 
 
 
316 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000685239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1668  transcriptional regulator, LysR family  45.95 
 
 
316 aa  295  8e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.12362e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01886  hypothetical protein  45.95 
 
 
316 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000554591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2269  transcriptional regulator Cbl  45.95 
 
 
316 aa  295  9e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  8.89139e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1583  transcriptional regulator CysB  42.81 
 
 
325 aa  295  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2077  transcriptional regulator CysB  44.92 
 
 
324 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2494  transcriptional regulator CysB  44.63 
 
 
327 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0971  transcriptional regulator Cbl  45.95 
 
 
316 aa  293  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000168411  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2607  transcriptional regulator CysB  44.63 
 
 
327 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00558949  decreased coverage  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2487  transcriptional regulator CysB  44.63 
 
 
327 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>