19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1813 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1813  Abortive infection protein  100 
 
 		 347 aa  660    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.104964  decreased coverage  0.0023677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  39.18 
 
 		 301 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1193  Abortive infection protein  34.72 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0509  hypothetical protein  35.15 
 
 		 386 aa  116  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0825  Abortive infection protein  39.67 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3335  abortive infection protein  35.35 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0128461  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22110  predicted metal-dependent membrane protease  33.88 
 
 		 400 aa  98.6  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.149179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3886  Abortive infection protein  32.08 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4058  Abortive infection protein  35.78 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312124  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02420  CAAX amino terminal protease family  29.56 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07080  CAAX amino terminal protease family  40.93 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.541158  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4288  Abortive infection protein  37.58 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5416  Abortive infection protein  32.61 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1810  Abortive infection protein  31.33 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0409959 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0130  abortive infection protein  31.49 
 
 		 300 aa  53.1  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15680  CAAX amino terminal protease family  28.88 
 
 		 339 aa  49.7  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0269  Abortive infection protein  34.86 
 
 		 309 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4016  abortive infection protein  31.4 
 
 		 293 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08301  hypothetical protein  26.38 
 
 		 327 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>