68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5062 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1194  hypothetical protein  69.07 
 
 		 638 aa  872    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4392  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  88.35 
 
 		 644 aa  1139    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4607  hypothetical protein  64.64 
 
 		 640 aa  849    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5062  hypothetical protein  100 
 
 		 644 aa  1290    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.828402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3464  hypothetical protein  65.12 
 
 		 640 aa  858    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5247  hypothetical protein  65.02 
 
 		 641 aa  850    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  88.82 
 
 		 644 aa  1139    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0906  hypothetical protein  69.07 
 
 		 638 aa  872    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0942  hypothetical protein  65.47 
 
 		 638 aa  872    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1235  hypothetical protein  79.97 
 
 		 641 aa  1038    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2205  hypothetical protein  65.51 
 
 		 630 aa  862    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5074  hypothetical protein  88.98 
 
 		 644 aa  1142    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1229  hypothetical protein  65.51 
 
 		 630 aa  862    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1516  hypothetical protein  79.97 
 
 		 641 aa  1038    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2169  hypothetical protein  69.07 
 
 		 638 aa  872    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0111  hypothetical protein  79.31 
 
 		 523 aa  868    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906593  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0314  hypothetical protein  65.47 
 
 		 638 aa  874    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390902  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0350  hypothetical protein  68.91 
 
 		 638 aa  856    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0091  hypothetical protein  79.97 
 
 		 641 aa  1038    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0087  hypothetical protein  78.83 
 
 		 647 aa  1031    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0224  hypothetical protein  65.53 
 
 		 713 aa  878    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0258  hypothetical protein  68.59 
 
 		 638 aa  850    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6684  hypothetical protein  64.31 
 
 		 660 aa  832    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182376  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0076  hypothetical protein  78.62 
 
 		 650 aa  1040    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0837767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1895  hypothetical protein  69.07 
 
 		 638 aa  872    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1927  hypothetical protein  65.47 
 
 		 638 aa  872    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4648  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  78.57 
 
 		 643 aa  1034    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.652579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4607  hypothetical protein  70.5 
 
 		 638 aa  942    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1575  hypothetical protein  78.77 
 
 		 650 aa  1041    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1677  hypothetical protein  65.63 
 
 		 638 aa  873    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1708  hypothetical protein  68.59 
 
 		 638 aa  852    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0407  hypothetical protein  64.34 
 
 		 640 aa  848    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3085  hypothetical protein  89.44 
 
 		 644 aa  1159    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0077  hypothetical protein  80.03 
 
 		 645 aa  1030    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.104126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0227  hypothetical protein  65.84 
 
 		 711 aa  877    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6419  hypothetical protein  68.68 
 
 		 644 aa  913    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.612972  normal  0.777893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5136  hypothetical protein  64.95 
 
 		 640 aa  854    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3206  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  98.45 
 
 		 644 aa  1273    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0905  hypothetical protein  71.92 
 
 		 638 aa  961    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3120  hypothetical protein  65.02 
 
 		 641 aa  850    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5025  hypothetical protein  64.86 
 
 		 641 aa  850    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.932638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1140  hypothetical protein  29.25 
 
 		 743 aa  223  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.782841  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3113  NHL repeat-containing protein  27.05 
 
 		 708 aa  197  6e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4260  hypothetical protein  27.83 
 
 		 729 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6951  NHL repeat containing protein  26.88 
 
 		 727 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3571  hypothetical protein  26.1 
 
 		 663 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68126  decreased coverage  0.00704751 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0755  hypothetical protein  26.65 
 
 		 722 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.974049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2290  hypothetical protein  26.65 
 
 		 718 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2429  hypothetical protein  26.37 
 
 		 775 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2230  hypothetical protein  25.03 
 
 		 733 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1968  hypothetical protein  24.23 
 
 		 733 aa  144  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0693  hypothetical protein  25.59 
 
 		 727 aa  139  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.315793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1072  hypothetical protein  26.02 
 
 		 761 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.437108 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0544  hypothetical protein  25.81 
 
 		 669 aa  134  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1872  hypothetical protein  25.81 
 
 		 669 aa  134  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721544  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1664  hypothetical protein  25.81 
 
 		 722 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789674  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1707  hypothetical protein  25.81 
 
 		 669 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.365611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2520  hypothetical protein  26.29 
 
 		 808 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.432249  normal  0.0659168 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4610  hypothetical protein  24.27 
 
 		 738 aa  128  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0530626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4395  hypothetical protein  24.4 
 
 		 738 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3972  hypothetical protein  24.4 
 
 		 738 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3557  hypothetical protein  24.4 
 
 		 738 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.744936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2113  hypothetical protein  24.1 
 
 		 738 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3865  hypothetical protein  23.73 
 
 		 730 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.647421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3361  hypothetical protein  23.46 
 
 		 738 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  25.06 
 
 		 1259 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  25.4 
 
 		 522 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 359 aa  45.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>