More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1290 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1290  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109093  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1905  LysR family transcriptional regulator  86.55 
 
 		 304 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.204877 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4554  LysR family transcriptional regulator  85.71 
 
 		 305 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1329  LysR family transcriptional regulator  84.19 
 
 		 304 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0928  LysR family transcriptional regulator  83.16 
 
 		 304 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1410  LysR family transcriptional regulator  83.16 
 
 		 304 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807333  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1388  LysR family transcriptional regulator  84.25 
 
 		 304 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275315 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2823  transcriptional regulator, LysR family  75.79 
 
 		 305 aa  407  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135524  normal  0.141091 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1661  LysR family transcriptional regulator  79.27 
 
 		 341 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0454  LysR family transcriptional regulator  79.27 
 
 		 341 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.499714  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1424  LysR family transcriptional regulator  79.27 
 
 		 337 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1312  LysR family transcriptional regulator  73.87 
 
 		 305 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1638  transcriptional regulator  79.27 
 
 		 341 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0706  LysR family transcriptional regulator  79.27 
 
 		 341 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.897426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0896  LysR family transcriptional regulator  79.27 
 
 		 321 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0937961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1817  hypothetical protein  79.27 
 
 		 321 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.504025  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2660  LysR family transcriptional regulator  79.27 
 
 		 321 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1612  LysR family transcriptional regulator  72.66 
 
 		 301 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0804  transcription regulator protein  56.21 
 
 		 302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.540321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0750  transcriptional regulator, LysR family  55.63 
 
 		 302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0820  transcriptional regulator, LysR family  56.14 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.194336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0854  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  55.67 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0895  putative transcriptional regulator  54.36 
 
 		 284 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0899891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09570  LysR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 284 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  50.74 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5127  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 295 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0272  LysR family transcriptional regulator  55.3 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1652  LysR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0547251  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0486  LysR substrate-binding  50.52 
 
 		 298 aa  245  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2646  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0121  transcriptional regulator, LysR family  48.65 
 
 		 304 aa  242  7e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0214  transcription regulator protein  47.2 
 
 		 288 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5034  transcriptional regulator, LysR family  44.76 
 
 		 301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0208  transcriptional regulator, LysR family  52.11 
 
 		 298 aa  235  7e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.502619  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3818  LysR family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 297 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.173651 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5316  transcriptional regulator, LysR family  45.42 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.680979  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4525  LysR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1385  LysR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 297 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134108  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46170  LysR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0324298 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1668  transcriptional regulator, LysR family  43.55 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3926  putative transcriptional regulator  44.79 
 
 		 290 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1608  LysR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 293 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2132  LysR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 293 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54811  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01483  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.61 
 
 		 293 aa  228  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2120  transcriptional regulator, LysR family  41.61 
 
 		 293 aa  228  8e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01494  hypothetical protein  41.61 
 
 		 293 aa  228  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1646  LysR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 293 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2395  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.86 
 
 		 291 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0377245  normal  0.580313 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3012  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  44.06 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.450438  hitchhiker  0.000703378 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2472  LysR family substrate binding transcriptional regulator  44.06 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4032  LysR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2570  LysR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1726  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1939  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514267  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2139  transcriptional regulator, LysR family  41.26 
 
 		 293 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0189  LysR family transcriptional regulator  51.08 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1558  LysR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 305 aa  225  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2661  transcriptional regulator, LysR family  43.73 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3275  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3152  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2703  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 289 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2562  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1680  transcriptional regulator, LysR family  41.26 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2893  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0897253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1450  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1636  putative LysR substrate binding domain  40.21 
 
 		 290 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1812  putative LysR substrate binding domain-containing protein  40.21 
 
 		 290 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1628  putative LysR substrate binding domain  40.21 
 
 		 290 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1695  putative LysR substrate binding domain  40.21 
 
 		 290 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1647  putative LysR substrate binding domain  40.21 
 
 		 290 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0636291  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0210  transcriptional regulator, LysR family  44.64 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2410  transcriptional regulator, LysR family  42.31 
 
 		 287 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.975942  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2004  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 283 aa  206  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 283 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 		 283 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 283 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 		 283 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  37.67 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2203  LysR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.460556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4716  LysR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 296 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0071  putative transcriptional regulator LysR-type  41.76 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120497  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2310  transcriptional regulator, LysR family  39.51 
 
 		 287 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0357  transcriptional regulator  41.64 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.449267  unclonable  0.0000000664485 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8516  transcriptional regulator, LysR family  41.94 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3308  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 294 aa  172  9e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2056  HTH-type transcriptional regulator GltR  33.79 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1081  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0280  LysR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6389  LysR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0907959  normal  0.0995777 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5516  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0587498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5880  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311857  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 288 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10830  LysR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 291 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>