More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5034 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5034  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
301 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5316  transcriptional regulator, LysR family  90.37 
 
 
301 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.680979  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09570  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
284 aa  255  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0895  putative transcriptional regulator  48.81 
 
 
284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0899891  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0272  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 
294 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1652  LysR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
299 aa  249  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0547251  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2646  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 
289 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0208  transcriptional regulator, LysR family  49.1 
 
 
298 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.502619  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5127  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
295 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0189  LysR family transcriptional regulator  49.1 
 
 
300 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1612  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
301 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1290  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
309 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109093  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1905  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.204877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1312  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 
305 aa  221  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843658  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2823  transcriptional regulator, LysR family  45.73 
 
 
305 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135524  normal  0.141091 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1329  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
304 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4554  LysR family transcriptional regulator  46.07 
 
 
305 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1388  LysR family transcriptional regulator  46.79 
 
 
304 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.275315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0820  transcriptional regulator, LysR family  43.2 
 
 
302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.194336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0750  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 
302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0928  LysR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1410  LysR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807333  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0804  transcription regulator protein  43.54 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.540321 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1638  transcriptional regulator  45 
 
 
341 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0454  LysR family transcriptional regulator  45 
 
 
341 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.499714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1661  LysR family transcriptional regulator  45 
 
 
341 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1424  LysR family transcriptional regulator  45 
 
 
337 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0706  LysR family transcriptional regulator  45 
 
 
341 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.897426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0896  LysR family transcriptional regulator  45 
 
 
321 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0937961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1817  hypothetical protein  45 
 
 
321 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.504025  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2660  LysR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
321 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0854  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.34 
 
 
297 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0210  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 
305 aa  191  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0214  transcription regulator protein  41.96 
 
 
288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2893  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
288 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0897253  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1647  putative LysR substrate binding domain  36.88 
 
 
290 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0636291  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1812  putative LysR substrate binding domain-containing protein  36.88 
 
 
290 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1636  putative LysR substrate binding domain  36.88 
 
 
290 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1628  putative LysR substrate binding domain  36.88 
 
 
290 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1695  putative LysR substrate binding domain  36.88 
 
 
290 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1726  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3152  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2139  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487971  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2562  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2703  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.664835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1680  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1646  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2132  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
293 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54811  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1608  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
293 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01483  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.02 
 
 
293 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2120  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 
293 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01494  hypothetical protein  35.02 
 
 
293 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1668  transcriptional regulator, LysR family  35.94 
 
 
296 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1939  transcriptional regulator, LysR family  36.65 
 
 
290 aa  169  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514267  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2004  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
292 aa  169  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1558  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
305 aa  169  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3275  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0812122 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2472  LysR family substrate binding transcriptional regulator  36.15 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3012  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  36.15 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.450438  hitchhiker  0.000703378 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2570  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0486  LysR substrate-binding  37.74 
 
 
298 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  38.95 
 
 
292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2395  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.68 
 
 
291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0377245  normal  0.580313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2661  transcriptional regulator, LysR family  36.01 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3818  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
297 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.173651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46170  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
290 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0324298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0121  transcriptional regulator, LysR family  35.09 
 
 
304 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3926  putative transcriptional regulator  34.16 
 
 
290 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1385  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
297 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134108  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4525  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4032  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
297 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2203  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
287 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.460556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1450  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
297 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 
283 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 
283 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 
283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0071  putative transcriptional regulator LysR-type  33.78 
 
 
292 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
283 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
314 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2410  transcriptional regulator, LysR family  32.27 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.975942  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5516  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0587498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5880  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311857  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6389  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 
291 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0907959  normal  0.0995777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10830  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133975  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1081  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440964  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2056  HTH-type transcriptional regulator GltR  32.03 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4716  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
296 aa  125  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
288 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 
288 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 
288 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
288 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
288 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 
288 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>