31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0947 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0947  lyase  100 
 
 
339 aa  672  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  1.29184e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2201  putative terpene cyclase  88.24 
 
 
269 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  1.44579e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1580  putative terpene cyclase  88.19 
 
 
286 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  3.63115e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0041  putative lyase  88.19 
 
 
286 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  9.93648e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0855  hypothetical protein  83.93 
 
 
178 aa  234  2e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00236687  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0040  hypothetical protein  95 
 
 
80 aa  135  1e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  1.65728e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0854  hypothetical protein  95 
 
 
80 aa  135  1e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.0010217  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2200  putative terpene cyclase  95 
 
 
80 aa  135  1e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  3.77513e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1581  putative terpene cyclase  95 
 
 
80 aa  135  1e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  4.70272e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  28.21 
 
 
329 aa  83.6  5e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  25.74 
 
 
327 aa  83.2  6e-15  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  27.83 
 
 
324 aa  82  1e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  22.98 
 
 
322 aa  81.6  2e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  30.51 
 
 
326 aa  79  1e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  26.19 
 
 
769 aa  78.2  2e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  26.1 
 
 
338 aa  72.4  1e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.41 
 
 
321 aa  67.4  3e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  4.45956e-05 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  24.11 
 
 
750 aa  67.4  4e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  22.11 
 
 
344 aa  63.5  4e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  22.02 
 
 
745 aa  62  1e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  25.5 
 
 
325 aa  62  1e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  23.42 
 
 
324 aa  61.2  3e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4149  hypothetical protein  22.43 
 
 
314 aa  60.5  4e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  28.86 
 
 
326 aa  59.3  9e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  23.1 
 
 
751 aa  57.8  3e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  22.39 
 
 
323 aa  56.6  6e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  20.12 
 
 
751 aa  53.9  4e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2608  hypothetical protein  29.51 
 
 
359 aa  53.9  4e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  23.19 
 
 
756 aa  53.5  5e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.22 
 
 
755 aa  52.4  1e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  24.28 
 
 
330 aa  50.4  4e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>