39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1777 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1798  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  465  1e-130  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0851898  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0126  hypothetical protein  99.58 
 
 
237 aa  464  1e-130  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  2.93987e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1777  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  465  1e-130  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  1.95228e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1039  hypothetical protein  99.58 
 
 
237 aa  464  1e-130  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  1.38687e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1769  hypothetical protein  99.58 
 
 
237 aa  464  1e-130  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  1.17921e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1281  hypothetical protein  99.58 
 
 
243 aa  464  1e-130  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  9.55438e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1953  hypothetical protein  99.16 
 
 
243 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  2.97307e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2533  hypothetical protein  91.56 
 
 
243 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1452  hypothetical protein  61.11 
 
 
235 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1412  hypothetical protein  61.11 
 
 
235 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0889401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4670  hypothetical protein  61.54 
 
 
233 aa  264  9e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574881  hitchhiker  0.00992931 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1723  hypothetical protein  64.68 
 
 
236 aa  252  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0130536  hitchhiker  7.57016e-05 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1530  hypothetical protein  60 
 
 
236 aa  242  4e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1050  hypothetical protein  60 
 
 
236 aa  242  4e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1506  hypothetical protein  60 
 
 
236 aa  242  4e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212232  hitchhiker  1.44009e-05 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1662  putative signal peptide protein  45.69 
 
 
242 aa  188  6e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2789  putative signal peptide protein  46.61 
 
 
242 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0031715  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1715  putative signal peptide protein  51.11 
 
 
223 aa  178  6e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0955  putative exported lipoprotein  45.67 
 
 
237 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833398  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0889  hypothetical protein  44.29 
 
 
216 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3032  putative exported lipoprotein  42.13 
 
 
243 aa  154  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338968  decreased coverage  0.00314115 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4138  hypothetical protein  46.23 
 
 
281 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.955129  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1025  hypothetical protein  50.31 
 
 
232 aa  152  3e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0546  hypothetical protein  50.31 
 
 
232 aa  152  3e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21388  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0984  hypothetical protein  50.31 
 
 
232 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295093  normal  0.1274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0718  putative exported lipoprotein  43.46 
 
 
247 aa  147  2e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.261936  normal  0.297451 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0901  hypothetical protein  44.76 
 
 
216 aa  145  4e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439946  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4257  putative lipoprotein  48.47 
 
 
260 aa  128  8e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.14352 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4367  putative lipoprotein  48.47 
 
 
260 aa  128  8e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11568  normal  0.560371 
 
 
-
 
NC_003296  RS02585  putative lipoprotein  47.53 
 
 
248 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143555  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2329  hypothetical protein  54.37 
 
 
237 aa  117  1e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.09763  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6346  hypothetical protein  37.74 
 
 
238 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1966  signal peptide protein  41.82 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.874063  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2366  putative signal peptide protein  40.96 
 
 
210 aa  91.7  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.369629 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2164  signal peptide protein  36 
 
 
210 aa  77.8  1e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0709272  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4717  hypothetical protein  28.77 
 
 
247 aa  68.6  9e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0538703  normal  0.011152 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2208  hypothetical protein  30.92 
 
 
252 aa  67  2e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2317  putative lipoprotein  28.76 
 
 
258 aa  66.6  3e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.927495  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2694  hypothetical protein  28.76 
 
 
212 aa  66.2  4e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>