240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1069 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.72 
 
 
926 aa  895  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  62.63 
 
 
930 aa  1085  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  99.9 
 
 
994 aa  2001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  62.09 
 
 
949 aa  1068  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  60.27 
 
 
982 aa  1089  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.18 
 
 
936 aa  741  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.96 
 
 
946 aa  762  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  62.09 
 
 
949 aa  1067  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  83.84 
 
 
1009 aa  1649  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  59.62 
 
 
947 aa  1041  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  85.51 
 
 
998 aa  1652  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  66.94 
 
 
1002 aa  1211  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.96 
 
 
946 aa  762  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  86.94 
 
 
994 aa  1639  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3081  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.76 
 
 
889 aa  754  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.134099  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  62.22 
 
 
951 aa  1090  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  65.22 
 
 
1009 aa  1254  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.3 
 
 
929 aa  877  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  60.63 
 
 
934 aa  1040  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  99.9 
 
 
994 aa  2001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  57.08 
 
 
923 aa  972  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  61.42 
 
 
949 aa  1084  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  85.96 
 
 
1004 aa  1665  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  84.55 
 
 
1009 aa  1647  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  60.78 
 
 
950 aa  1097  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.09332e-07 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3135  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.67 
 
 
929 aa  723  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365231  normal  0.570221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.05 
 
 
928 aa  857  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.61 
 
 
932 aa  972  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  79.45 
 
 
1030 aa  1535  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  79.16 
 
 
1075 aa  1558  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  67.05 
 
 
1001 aa  1214  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.94 
 
 
936 aa  892  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.97 
 
 
937 aa  728  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.7 
 
 
920 aa  985  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  99.9 
 
 
994 aa  2001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.96 
 
 
946 aa  762  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  99.8 
 
 
1024 aa  1996  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 
994 aa  2004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  46.18 
 
 
945 aa  719  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.9 
 
 
933 aa  872  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0841  Phosphoenolpyruvate carboxylase  48.45 
 
 
939 aa  697  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.39 
 
 
937 aa  960  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  46.2 
 
 
921 aa  711  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  64.73 
 
 
1006 aa  1259  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  66.4 
 
 
985 aa  1222  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  96.98 
 
 
1088 aa  1886  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  84.9 
 
 
998 aa  1659  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  99.9 
 
 
994 aa  2001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.25 
 
 
918 aa  910  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  84.55 
 
 
1008 aa  1644  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.87 
 
 
928 aa  878  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.98 
 
 
933 aa  885  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1714  phosphoenolpyruvate carboxylase  59.71 
 
 
957 aa  1056  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.686661  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0707  Phosphoenolpyruvate carboxylase  40.64 
 
 
884 aa  648  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  99.7 
 
 
1085 aa  1996  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  82.65 
 
 
994 aa  1559  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.86 
 
 
929 aa  875  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  60.93 
 
 
970 aa  1079  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1084  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.95 
 
 
929 aa  619  1e-176  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  40.53 
 
 
906 aa  613  1e-174  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0759  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.78 
 
 
931 aa  612  1e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0760  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.42 
 
 
940 aa  592  1e-168  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.81 
 
 
905 aa  584  1e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.56 
 
 
929 aa  561  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.86 
 
 
952 aa  561  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.03 
 
 
933 aa  559  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.32 
 
 
957 aa  556  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.94 
 
 
929 aa  549  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  1.74255e-10 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.26 
 
 
931 aa  550  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.94 
 
 
929 aa  549  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.25 
 
 
929 aa  546  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.96 
 
 
938 aa  537  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.29 
 
 
947 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0304  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.14 
 
 
931 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.65 
 
 
939 aa  521  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.74 
 
 
896 aa  518  1e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.68 
 
 
946 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.3 
 
 
938 aa  513  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1468  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.82 
 
 
898 aa  511  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.77 
 
 
898 aa  507  1e-142  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3689  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.43 
 
 
900 aa  506  1e-142  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.37 
 
 
898 aa  507  1e-142  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.77 
 
 
882 aa  503  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.14 
 
 
932 aa  503  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.41 
 
 
926 aa  493  1e-138  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.41 
 
 
896 aa  493  1e-138  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.03 
 
 
954 aa  492  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2494  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.56 
 
 
897 aa  489  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.65 
 
 
926 aa  490  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.17 
 
 
900 aa  483  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.4 
 
 
883 aa  483  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.76 
 
 
994 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.45 
 
 
942 aa  482  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.76 
 
 
994 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37 
 
 
938 aa  477  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16951  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.87 
 
 
1007 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.2 
 
 
945 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.76 
 
 
989 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17621  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.03 
 
 
989 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.22 
 
 
937 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>