120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3671 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  357  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  81.76 
 
 
175 aa  292  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  64.16 
 
 
173 aa  214  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  63.01 
 
 
178 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  63.01 
 
 
175 aa  208  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1358  hypothetical protein  59.43 
 
 
177 aa  205  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  47.92 
 
 
137 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  48.51 
 
 
135 aa  77  1e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  46.32 
 
 
135 aa  75.9  3e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  51.32 
 
 
87 aa  71.2  7e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  47.13 
 
 
88 aa  68.9  4e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  45.35 
 
 
89 aa  68.2  6e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5365  GP29  42.17 
 
 
89 aa  68.2  6e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2104  PAAR motif-containing protein  43.75 
 
 
141 aa  67.8  8e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  47.06 
 
 
86 aa  67.4  1e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  33.54 
 
 
172 aa  66.2  2e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  43.75 
 
 
89 aa  65.1  5e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44930  hypothetical protein  46.75 
 
 
86 aa  63.9  1e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00624733  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2330  PAAR motif-containing protein  42.71 
 
 
141 aa  63.5  1e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1928  PAAR motif-containing protein  42 
 
 
141 aa  63.5  1e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0961  hypothetical protein  46.15 
 
 
88 aa  63.5  1e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3641  GP29  46.58 
 
 
83 aa  63.2  2e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5071  PAAR repeat-containing protein  40.23 
 
 
136 aa  62.4  3e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104912 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2340  PAAR motif-containing protein  41 
 
 
141 aa  62  4e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  45.57 
 
 
84 aa  62  5e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1531  PAAR motif-containing protein  41.67 
 
 
141 aa  61.6  6e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3228  PAAR motif-containing protein  43.18 
 
 
87 aa  61.2  7e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1554  PAAR motif-containing protein  40.62 
 
 
140 aa  61.2  7e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1728  PAAR motif-containing protein  40.62 
 
 
140 aa  61.2  7e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0092  PAAR motif-containing protein  43.18 
 
 
87 aa  61.2  7e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2381  PAAR motif-containing protein  40.62 
 
 
141 aa  61.2  7e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2496  PAAR motif-containing protein  40.62 
 
 
141 aa  61.2  7e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.433555  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  60.1  1e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5468  GP29  43.59 
 
 
81 aa  60.5  1e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5197  hypothetical protein  29.71 
 
 
178 aa  60.5  1e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0609  PAAR motif-containing protein  39.58 
 
 
141 aa  59.7  2e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364602  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0546  hypothetical protein  39.58 
 
 
141 aa  59.7  2e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1327  PAAR motif-containing protein  39.58 
 
 
141 aa  59.7  2e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.620595  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0734  GP29  41.33 
 
 
86 aa  60.1  2e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  46.99 
 
 
102 aa  60.1  2e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  34.44 
 
 
165 aa  60.1  2e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0098  PAAR motif-containing protein  42.05 
 
 
87 aa  58.5  4e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314734  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  30.98 
 
 
188 aa  58.9  4e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1810  PAAR repeat-containing protein  44.19 
 
 
87 aa  58.5  5e-08  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316839  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  44.44 
 
 
453 aa  58.5  5e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  44.87 
 
 
83 aa  58.2  7e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4517  PAAR repeat-containing protein  40.74 
 
 
86 aa  57.8  8e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1586  PAAR motif-containing protein  40.91 
 
 
87 aa  57.4  9e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1612  PAAR motif-containing protein  40.91 
 
 
87 aa  56.6  2e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4102  hypothetical protein  48.19 
 
 
107 aa  57  2e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0103  PAAR motif-containing protein  40.91 
 
 
87 aa  56.6  2e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00394  hypothetical protein  41.98 
 
 
88 aa  57  2e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33074  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0130  PAAR motif-containing protein  40.91 
 
 
87 aa  56.6  2e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1693  PAAR motif-containing protein  40.91 
 
 
87 aa  56.6  2e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05224  hypothetical protein  44.16 
 
 
88 aa  56.2  2e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  43.18 
 
 
86 aa  55.8  3e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0203  PAAR motif-containing protein  40.91 
 
 
87 aa  55.8  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00559285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  38.75 
 
 
137 aa  55.8  3e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  40.91 
 
 
93 aa  55.1  5e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3217  hypothetical protein  41.56 
 
 
90 aa  54.7  7e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0242808 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04484  hypothetical protein  32.54 
 
 
149 aa  53.9  1e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3874  PAAR domain-containing protein  41.46 
 
 
88 aa  52.8  2e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.626619  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0903  PAAR domain-containing protein  41.77 
 
 
101 aa  52.8  2e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  39.74 
 
 
83 aa  53.5  2e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6434  PAAR repeat-containing protein  39.74 
 
 
83 aa  53.1  2e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03514  paar motif family  40.54 
 
 
133 aa  53.1  2e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  40 
 
 
87 aa  52.4  3e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3774  hypothetical protein  38.55 
 
 
194 aa  52.8  3e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0959  PAAR repeat-containing protein  41.46 
 
 
88 aa  52.8  3e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7018  PAAR repeat-containing protein  39.33 
 
 
92 aa  52.8  3e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6436  PAAR repeat-containing protein  39.74 
 
 
83 aa  52.8  3e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  41.86 
 
 
88 aa  52  4e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2227  PAAR repeat-containing protein  39.74 
 
 
83 aa  51.6  5e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798766  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2590  PAAR repeat-containing protein  39.74 
 
 
83 aa  51.6  6e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0004  PAAR repeat-containing protein  42.67 
 
 
134 aa  49.7  2e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0248137  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  38.75 
 
 
87 aa  49.7  2e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  38.75 
 
 
87 aa  49.7  2e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0051  hypothetical protein  29.65 
 
 
178 aa  49.7  2e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0341142  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  44.74 
 
 
88 aa  49.7  2e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  38.75 
 
 
87 aa  49.7  2e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  39.08 
 
 
94 aa  48.9  4e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  37.93 
 
 
92 aa  48.9  4e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0552  hypothetical protein  29.87 
 
 
200 aa  48.5  4e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2706  PAAR motif-containing protein  40 
 
 
88 aa  48.5  5e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1603  PAAR motif-containing protein  40 
 
 
88 aa  48.1  5e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1577  PAAR motif-containing protein  40 
 
 
88 aa  48.1  5e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4128  PAAR  28.12 
 
 
164 aa  48.5  5e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0500  hypothetical protein  40 
 
 
88 aa  48.1  5e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.714041  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1375  PAAR motif-containing protein  40 
 
 
88 aa  48.1  5e-05  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.573546  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0657  PAAR motif-containing protein  40 
 
 
88 aa  48.1  5e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  28.83 
 
 
191 aa  48.1  6e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3180  hypothetical protein  43.75 
 
 
84 aa  47.8  7e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.137745 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0079  hypothetical protein  35.09 
 
 
470 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1765  PAAR motif-containing protein  40 
 
 
88 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5205  PAAR repeat-containing protein  38.27 
 
 
85 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  4.29039e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3249  PAAR repeat-containing protein  39.74 
 
 
87 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0505406  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1677  PAAR repeat-containing protein  40.66 
 
 
91 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954396  hitchhiker  0.00616072 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0990  hypothetical protein  35.63 
 
 
93 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  41.94 
 
 
94 aa  44.3  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3367  PAAR repeat-containing protein  37.04 
 
 
85 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>