More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0730 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  100 
 
 
228 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  100 
 
 
228 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  100 
 
 
228 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  100 
 
 
228 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  99.56 
 
 
228 aa  460  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  99.56 
 
 
228 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  100 
 
 
228 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  95.18 
 
 
240 aa  440  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  83.33 
 
 
244 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  83.33 
 
 
244 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  83.33 
 
 
228 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  82.89 
 
 
260 aa  384  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  82.02 
 
 
228 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  81.14 
 
 
240 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  81.14 
 
 
240 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  75.44 
 
 
252 aa  360  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  75.44 
 
 
228 aa  358  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  72.81 
 
 
228 aa  338  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  49.53 
 
 
231 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  49.07 
 
 
224 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11460  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.58 
 
 
233 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0237278  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0879  HAD family hydrolase  47.17 
 
 
232 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  47.17 
 
 
232 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  46.85 
 
 
230 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0336  HAD-superfamily hydrolase  47.17 
 
 
232 aa  166  3e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  47.17 
 
 
232 aa  166  3e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  47.17 
 
 
232 aa  166  3e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  47.17 
 
 
232 aa  166  3e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0698  HAD-superfamily hydrolase  46.23 
 
 
232 aa  166  3e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0875  HAD family hydrolase  47.17 
 
 
232 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02024  hydrolase  44.95 
 
 
206 aa  158  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.247086  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2640  HAD family hydrolase  44.81 
 
 
237 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2508  HAD family hydrolase  44.19 
 
 
237 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.076946  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1982  HAD family hydrolase  44.81 
 
 
237 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2592  HAD family hydrolase  44.81 
 
 
237 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2616  HAD family hydrolase  44.81 
 
 
237 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973469  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0705  HAD family hydrolase  45.28 
 
 
232 aa  151  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531272  normal  0.478044 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3243  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.09 
 
 
237 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  normal  0.9958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  40.09 
 
 
240 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5923  HAD family hydrolase  44.19 
 
 
228 aa  148  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.99 
 
 
229 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  41.53 
 
 
222 aa  139  4e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0493  HAD family hydrolase  41.78 
 
 
230 aa  138  8e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0405108  hitchhiker  0.00191213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  40.67 
 
 
217 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  37.16 
 
 
229 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  37.79 
 
 
228 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  37.79 
 
 
228 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2141  hypothetical protein  44.08 
 
 
232 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00191152  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  36.27 
 
 
233 aa  136  3e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  40.38 
 
 
217 aa  135  6e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  35.32 
 
 
231 aa  134  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  35.35 
 
 
230 aa  134  1e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5664  HAD family hydrolase  42.27 
 
 
242 aa  134  2e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.665431 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3728  HAD family hydrolase  41.82 
 
 
242 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4640  HAD family hydrolase  41.82 
 
 
242 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  38.29 
 
 
227 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  37.3 
 
 
223 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  39.91 
 
 
219 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  37.96 
 
 
242 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.16 
 
 
229 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.98 
 
 
232 aa  130  2e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  38.18 
 
 
225 aa  130  2e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.46 
 
 
231 aa  128  8e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.34 
 
 
228 aa  128  9e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6257  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.44 
 
 
240 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766914 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.18 
 
 
229 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.97 
 
 
223 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  37.04 
 
 
219 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.01 
 
 
232 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  37.22 
 
 
235 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.44 
 
 
228 aa  121  1e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  32.73 
 
 
230 aa  119  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  33.49 
 
 
218 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  34.12 
 
 
214 aa  117  1e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  43.62 
 
 
218 aa  117  1e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  36.92 
 
 
245 aa  117  1e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  35.24 
 
 
204 aa  117  2e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  35.62 
 
 
229 aa  117  2e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.72 
 
 
219 aa  117  2e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  37.84 
 
 
223 aa  115  4e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  36.02 
 
 
228 aa  114  8e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.56 
 
 
223 aa  114  1e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  35.91 
 
 
229 aa  114  1e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.04 
 
 
214 aa  113  2e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  32.86 
 
 
223 aa  113  2e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  32.86 
 
 
223 aa  112  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1330  HAD family hydrolase  37.67 
 
 
230 aa  112  4e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
228 aa  112  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  35.45 
 
 
230 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
230 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.74 
 
 
229 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.422409  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  33.49 
 
 
224 aa  109  4e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  31.37 
 
 
223 aa  108  8e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3578  hypothetical protein  35.79 
 
 
227 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  37.44 
 
 
216 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0113  HAD family hydrolase  32.58 
 
 
215 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254082  normal  0.189909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4120  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
237 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  37.3 
 
 
208 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  35.33 
 
 
228 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  35.33 
 
 
228 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>