More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5265 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5265  putative glutathione transferase  100 
 
 
234 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0071298  normal  0.528332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  71.11 
 
 
239 aa  334  6e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  69.64 
 
 
239 aa  327  1e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  67.86 
 
 
237 aa  326  1e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  64.73 
 
 
235 aa  313  1e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  61.47 
 
 
239 aa  298  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0980  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.7 
 
 
237 aa  264  9e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.88 
 
 
235 aa  260  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.98 
 
 
235 aa  260  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.9 
 
 
232 aa  259  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  54.39 
 
 
229 aa  259  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  54.74 
 
 
232 aa  259  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  54.55 
 
 
229 aa  258  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  56.34 
 
 
214 aa  258  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3329  Glutathione S-transferase domain  54.98 
 
 
235 aa  258  8e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.71 
 
 
261 aa  256  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  53.71 
 
 
233 aa  255  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  52.21 
 
 
234 aa  255  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  55.87 
 
 
213 aa  254  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3453  Glutathione S-transferase domain  53.68 
 
 
235 aa  254  1e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  55.87 
 
 
213 aa  253  1e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  4.21189e-05 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2356  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.6 
 
 
231 aa  252  4e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4144  glutathione S-transferase-like protein  53.22 
 
 
235 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  54.87 
 
 
230 aa  251  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  53.45 
 
 
239 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  55.72 
 
 
209 aa  250  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.84 
 
 
233 aa  249  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  52.84 
 
 
233 aa  248  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  54.19 
 
 
233 aa  248  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.16 
 
 
231 aa  248  8e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  57.58 
 
 
233 aa  247  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3373  putative glutathione S-transferase  50.86 
 
 
232 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3409  putative glutathione S-transferase  50.86 
 
 
232 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.1 
 
 
230 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3416  putative glutathione S-transferase-like protein  50.86 
 
 
232 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2524  putative glutathione S-transferase  50.86 
 
 
232 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1120  putative glutathione S-transferase  50.86 
 
 
232 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0258  putative glutathione S-transferase  50.86 
 
 
232 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  56.22 
 
 
209 aa  245  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  49.79 
 
 
235 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.89 
 
 
230 aa  245  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1641  Glutathione S-transferase domain protein  53.59 
 
 
240 aa  244  7e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606226  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.51 
 
 
233 aa  244  7e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1238  hypothetical protein  49.57 
 
 
232 aa  244  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00464821  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.1 
 
 
230 aa  244  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  53.1 
 
 
230 aa  243  1e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.1 
 
 
230 aa  243  1e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.68 
 
 
235 aa  244  1e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  53.51 
 
 
229 aa  243  2e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  52.44 
 
 
230 aa  242  4e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5178  glutathione S-transferase-like  48.28 
 
 
232 aa  241  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3320  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.92 
 
 
209 aa  241  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.62213e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.65 
 
 
230 aa  241  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  53.28 
 
 
230 aa  241  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  51.56 
 
 
230 aa  241  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  51.56 
 
 
230 aa  241  8e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  51.98 
 
 
255 aa  240  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  53.22 
 
 
236 aa  239  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2590  glutathione S-transferase, N- domain  54.55 
 
 
215 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153757  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2699  glutathione S-transferase, N- domain  54.55 
 
 
215 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2578  glutathione S-transferase, N- domain  54.55 
 
 
215 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  0.255018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2490  glutathione S-transferase, N- domain  54.55 
 
 
215 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00139167  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2536  glutathione S-transferase, N- domain  54.55 
 
 
215 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0018218  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  51.75 
 
 
229 aa  238  7e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.89 
 
 
230 aa  238  7e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2458  glutathione S-transferase  55.05 
 
 
215 aa  237  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00690199  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3442  glutathione S-transferase  55.05 
 
 
215 aa  237  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.26275e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2846  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.99 
 
 
263 aa  238  9e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.130993  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  53.22 
 
 
236 aa  237  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2851  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.47 
 
 
207 aa  237  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0434229  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  53.23 
 
 
208 aa  237  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  53.68 
 
 
229 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.56 
 
 
231 aa  235  5e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2678  glutathione S-transferase  54.55 
 
 
215 aa  235  6e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.01347e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2452  glutathione S-transferase  54.55 
 
 
215 aa  235  6e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.50471e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2596  glutathione S-transferase  54.55 
 
 
215 aa  235  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  8.60005e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02227  predicted glutathione S-transferase  54.55 
 
 
215 aa  235  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0437248  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1354  Glutathione S-transferase domain protein  54.55 
 
 
215 aa  235  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000942555  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02187  hypothetical protein  54.55 
 
 
215 aa  235  6e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0695509  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1350  glutathione S-transferase  54.55 
 
 
215 aa  235  6e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0219801  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  51.3 
 
 
234 aa  234  1e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.38 
 
 
236 aa  233  1e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.4 
 
 
242 aa  231  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  52.74 
 
 
208 aa  231  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  49.78 
 
 
230 aa  231  8e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  50.22 
 
 
230 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.9 
 
 
211 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3195  Glutathione S-transferase domain  51.89 
 
 
233 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16528  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  50.42 
 
 
236 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.9 
 
 
211 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  55.88 
 
 
211 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0662  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.57 
 
 
233 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  54.9 
 
 
211 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1664  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.15 
 
 
240 aa  221  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2407  putative glutathione S-transferase  54.5 
 
 
235 aa  221  1e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00274689  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  49.77 
 
 
222 aa  219  2e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.77 
 
 
222 aa  219  2e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.77 
 
 
222 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.68 
 
 
222 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  53.4 
 
 
228 aa  218  4e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>