44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1101 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  349  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  46.39 
 
 
169 aa  167  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  48.25 
 
 
169 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  42.94 
 
 
167 aa  157  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  44.1 
 
 
169 aa  154  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  41.61 
 
 
164 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  44.38 
 
 
162 aa  146  1e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  40.37 
 
 
167 aa  145  2e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  40.37 
 
 
167 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  40.37 
 
 
204 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  40.37 
 
 
169 aa  138  4e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  40 
 
 
175 aa  127  5e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  40.12 
 
 
165 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  33.12 
 
 
190 aa  87.8  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  33.73 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  31.46 
 
 
182 aa  85.1  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  30.3 
 
 
178 aa  85.1  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  32.41 
 
 
191 aa  84  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  32.03 
 
 
199 aa  82  4e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  31.47 
 
 
178 aa  80.5  1e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  29.29 
 
 
227 aa  80.5  1e-14  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  29.37 
 
 
227 aa  78.6  4e-14  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  31.97 
 
 
192 aa  77  1e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  29.45 
 
 
186 aa  77  1e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  29.05 
 
 
209 aa  73.6  1e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  29.71 
 
 
177 aa  70.1  1e-11  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  28.67 
 
 
175 aa  68.2  6e-11  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  26.39 
 
 
176 aa  62  3e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  28.97 
 
 
175 aa  62.4  3e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  25.75 
 
 
176 aa  62.4  3e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  25.75 
 
 
176 aa  62.4  3e-09  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  25.14 
 
 
203 aa  59.3  3e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  28.26 
 
 
168 aa  58.9  3e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  35.9 
 
 
182 aa  58.9  3e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  22.86 
 
 
206 aa  57.8  8e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  21.77 
 
 
241 aa  55.5  3e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  24.86 
 
 
227 aa  52.4  3e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  24.86 
 
 
227 aa  52.4  3e-06  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  22.4 
 
 
225 aa  50.4  1e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  24.8 
 
 
166 aa  48.1  5e-05  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2793  hypothetical protein  25.74 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_002978  WD1065  hypothetical protein  25.5 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0282386  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1424  hypothetical protein  47.37 
 
 
39 aa  41.2  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>