142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0418 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0418  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  600  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0050  hypothetical protein  73.7 
 
 
291 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0035  hypothetical protein  73.36 
 
 
291 aa  437  1e-122  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0028  hypothetical protein  68.94 
 
 
296 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47407e-05 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3681  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  61.36 
 
 
292 aa  338  7e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0148  hypothetical protein  58.4 
 
 
281 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0143  hypothetical protein  54.3 
 
 
297 aa  308  1e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0160  hypothetical protein  53.61 
 
 
297 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0318  putative hemolysin  52.54 
 
 
316 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361608  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4880  hypothetical protein  56.72 
 
 
332 aa  298  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.055868  normal  0.748823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0412  hypothetical protein  54.14 
 
 
337 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.666795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4926  hypothetical protein  55.97 
 
 
332 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0408  hypothetical protein  54.14 
 
 
337 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4417  hypothetical protein  56.34 
 
 
332 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704988  normal  0.744356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0699  hypothetical protein  52.81 
 
 
315 aa  288  6e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0333  putative hemolysin-like protein  54.24 
 
 
384 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515717  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3597  hypothetical protein  53.76 
 
 
341 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.485263  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4721  hypothetical protein  53.16 
 
 
332 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325273  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0314  hypothetical protein  51.13 
 
 
321 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4208  hypothetical protein  51.67 
 
 
330 aa  274  1e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.159321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1116  hypothetical protein  53.23 
 
 
332 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3632  hypothetical protein  47.43 
 
 
305 aa  262  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1654  hypothetical protein  48.33 
 
 
304 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.816423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3768  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  44.23 
 
 
266 aa  213  3e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2886  putative hemolysin-like protein  47.22 
 
 
265 aa  206  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801461  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2102  hypothetical protein  44.05 
 
 
281 aa  200  2e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3519  hypothetical protein  45.6 
 
 
261 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3826  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  45.2 
 
 
261 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3807  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.82 
 
 
261 aa  183  4e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395823  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1335  putative hemolysin-like protein  41.27 
 
 
270 aa  179  5e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4506  hypothetical protein  40.55 
 
 
259 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2436  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  38.98 
 
 
258 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1472  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.44 
 
 
258 aa  159  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.031802  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1208  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  37.85 
 
 
253 aa  153  3e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0469  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  37.45 
 
 
249 aa  147  2e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00940053  normal  0.968751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3934  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  38.15 
 
 
250 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.638634  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6049  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  36.43 
 
 
256 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1709  hypothetical protein  37.3 
 
 
277 aa  134  1e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.676906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2017  hypothetical protein  37.3 
 
 
277 aa  134  2e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  37.3 
 
 
307 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0059  hypothetical protein  35.16 
 
 
258 aa  131  1e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3535  hypothetical protein  36.82 
 
 
258 aa  131  1e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1275  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  37.94 
 
 
270 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599594  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0891  hypothetical protein  36.36 
 
 
271 aa  129  5e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1538  hypothetical protein  36.11 
 
 
278 aa  129  5e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642798  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2849  hypothetical protein  37.55 
 
 
270 aa  128  1e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  0.909838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3452  hypothetical protein  36.65 
 
 
255 aa  128  1e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320745  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0369  hypothetical protein  36.22 
 
 
285 aa  127  2e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2176  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  35.92 
 
 
283 aa  127  2e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.525625 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0583  putative hemolysin-like protein  36.47 
 
 
320 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1221  putative hemolysin-like protein  36.86 
 
 
268 aa  125  8e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1196  putative hemolysin-like protein  36.86 
 
 
268 aa  125  8e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0329892  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2736  putative hemolysin  34.8 
 
 
271 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0325  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  34.66 
 
 
283 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0746411  normal  0.0207105 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1311  putative hemolysin-like protein  35.43 
 
 
268 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2581  hypothetical protein  35 
 
 
279 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571368 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2621  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  35.41 
 
 
265 aa  122  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0630357  normal  0.540771 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4454  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  35.43 
 
 
268 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1293  putative hemolysin-like protein  35.43 
 
 
268 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418328  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1997  putative hemolysin-like protein  36.61 
 
 
268 aa  122  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351889  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2158  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  34.66 
 
 
281 aa  120  2e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0592  hypothetical protein  35.94 
 
 
250 aa  119  5e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12334  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0797  hypothetical protein  35.94 
 
 
272 aa  119  5e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2243  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  34.41 
 
 
294 aa  119  5e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1503  hypothetical protein  35.94 
 
 
272 aa  119  5e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1310  hypothetical protein  35.94 
 
 
250 aa  119  5e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0560  hypothetical protein  35.94 
 
 
250 aa  119  5e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1533  hypothetical protein  35.94 
 
 
272 aa  119  5e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1704  hypothetical protein  35.94 
 
 
301 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2757  hypothetical protein  35.46 
 
 
338 aa  118  1e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00398439  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2028  hypothetical protein  36.03 
 
 
282 aa  118  1e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.131913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2305  hypothetical protein  33.82 
 
 
286 aa  116  4e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.050145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1121  hypothetical protein  36.58 
 
 
249 aa  115  1e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1049  putative hemolysin  34 
 
 
277 aa  115  1e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2379  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  33.59 
 
 
278 aa  114  2e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1479  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N-acyltransferase  33.59 
 
 
278 aa  114  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4353  hypothetical protein  34.27 
 
 
251 aa  112  1e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4048  hypothetical protein  34.68 
 
 
251 aa  111  1e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2912  hypothetical protein  32.09 
 
 
267 aa  110  4e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0874  conserved hypothetical protein, predicted autoinducer synthesis protein family  32.24 
 
 
258 aa  109  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.936705  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0726  hypothetical protein  32.24 
 
 
258 aa  109  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2103  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4464  hypothetical protein  33.47 
 
 
251 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.0135664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1287  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  33.6 
 
 
251 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0963  hypothetical protein  33.47 
 
 
251 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.07893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0924  hypothetical protein  33.47 
 
 
251 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1440  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  32.68 
 
 
261 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.907823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0990  hypothetical protein  33.47 
 
 
251 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00020068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2322  putative hemolysin  34.68 
 
 
253 aa  102  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37760  hypothetical protein  31.69 
 
 
252 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1032  hypothetical protein  32.79 
 
 
286 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4066  hypothetical protein  32.26 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311734  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1707  putative acyl-CoA N-acyltransferases (Nat) superfamily protein  32.1 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189579  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56560  hypothetical protein  33.07 
 
 
251 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492473  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1138  hypothetical protein  26.36 
 
 
280 aa  97.1  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.194098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4921  hypothetical protein  32.46 
 
 
251 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4257  hypothetical protein  32.43 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1892  putative hemolysin  28.27 
 
 
251 aa  93.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185839  normal  0.463503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1126  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  32.92 
 
 
243 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1900  hypothetical protein  33.73 
 
 
271 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>