32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2720 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  100 
 
 
535 aa  1074    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  39.01 
 
 
533 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  39.21 
 
 
533 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  39.72 
 
 
526 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  37.13 
 
 
532 aa  335  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  36.35 
 
 
517 aa  296  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  35.76 
 
 
528 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  34.95 
 
 
528 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  34.12 
 
 
546 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  35.37 
 
 
547 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  30.28 
 
 
546 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  30.28 
 
 
546 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  27.24 
 
 
543 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  29.03 
 
 
536 aa  68.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  26.53 
 
 
618 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  27.09 
 
 
557 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  30.29 
 
 
569 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  29.03 
 
 
592 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  29.03 
 
 
592 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
513 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  27.09 
 
 
544 aa  52.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  25.94 
 
 
607 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  28.07 
 
 
531 aa  52  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  29.48 
 
 
516 aa  50.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  29.48 
 
 
516 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  28.34 
 
 
516 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  29.48 
 
 
516 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  29.48 
 
 
516 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
510 aa  48.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  25.74 
 
 
531 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  26.11 
 
 
534 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  26.92 
 
 
492 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>