199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3926 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
608 aa  1223    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  45.33 
 
 
601 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00310  glutaminase  43.59 
 
 
645 aa  426  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  39.32 
 
 
624 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  41.51 
 
 
620 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  39.83 
 
 
624 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  45.37 
 
 
483 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  38.81 
 
 
613 aa  362  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  47.13 
 
 
425 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  48.7 
 
 
334 aa  313  9e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  47.88 
 
 
343 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  42.52 
 
 
422 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  47.23 
 
 
343 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  46.73 
 
 
331 aa  306  7e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  49.33 
 
 
318 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  43.38 
 
 
412 aa  290  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  40.14 
 
 
418 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04560  glutaminase  35.25 
 
 
615 aa  285  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.393943  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  45.16 
 
 
343 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22150  L-glutaminase  47 
 
 
456 aa  274  4.0000000000000004e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  47.45 
 
 
331 aa  254  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  42.35 
 
 
332 aa  246  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  41.58 
 
 
330 aa  239  8e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  40.66 
 
 
338 aa  232  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  40.59 
 
 
310 aa  230  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  40.59 
 
 
310 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  40.59 
 
 
310 aa  229  8e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  40.59 
 
 
310 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  40.26 
 
 
310 aa  229  8e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  42.66 
 
 
310 aa  229  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  42.66 
 
 
310 aa  229  9e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  41.41 
 
 
310 aa  229  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  40.26 
 
 
310 aa  228  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06680  glutaminase  43.06 
 
 
347 aa  227  6e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  42.31 
 
 
311 aa  223  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  40.67 
 
 
346 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  40.54 
 
 
304 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  40.54 
 
 
304 aa  218  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  40.54 
 
 
304 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  40.54 
 
 
304 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  40.54 
 
 
304 aa  218  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  40.54 
 
 
304 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  41.16 
 
 
331 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2254  glutaminase  37.16 
 
 
335 aa  216  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2130  glutaminase  37.16 
 
 
335 aa  216  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2143  glutaminase  37.16 
 
 
335 aa  216  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  40.2 
 
 
306 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  40.8 
 
 
304 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  40.64 
 
 
317 aa  214  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  40.47 
 
 
333 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  40.47 
 
 
304 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  40.59 
 
 
304 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  39.8 
 
 
304 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  40.59 
 
 
304 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  34.87 
 
 
313 aa  211  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  40.26 
 
 
304 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0048  glutaminase  36.18 
 
 
310 aa  210  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  39.79 
 
 
305 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  39.79 
 
 
305 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2917  glutaminase  40 
 
 
434 aa  207  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1127  glutaminase  39.32 
 
 
304 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  41.7 
 
 
309 aa  204  4e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  38.26 
 
 
304 aa  201  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7656  Glutaminase  42.47 
 
 
316 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5773  glutaminase  38.23 
 
 
304 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4040  glutaminase  38.41 
 
 
307 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0235597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  42.91 
 
 
306 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2870  glutaminase  41.87 
 
 
304 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2867  glutaminase  40.79 
 
 
307 aa  197  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.705763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1222  glutaminase  39.27 
 
 
304 aa  196  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0064518  normal  0.448256 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01481  predicted glutaminase  36.91 
 
 
308 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01492  hypothetical protein  36.91 
 
 
308 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3365  glutaminase  39.22 
 
 
304 aa  195  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2122  Glutaminase  36.91 
 
 
308 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0470209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  35.15 
 
 
326 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1682  glutaminase  36.91 
 
 
308 aa  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.670417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2134  glutaminase  36.91 
 
 
308 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  35.15 
 
 
326 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2137  glutaminase  36.91 
 
 
308 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.200055  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1648  glutaminase  36.91 
 
 
308 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1606  glutaminase  36.91 
 
 
308 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1724  glutaminase  36.91 
 
 
308 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.334681  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1143  glutaminase  38.1 
 
 
304 aa  194  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.118169 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  35.15 
 
 
326 aa  194  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  35.15 
 
 
326 aa  194  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  35.15 
 
 
326 aa  194  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  35.15 
 
 
326 aa  194  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  34.81 
 
 
326 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  34.81 
 
 
326 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1183  glutaminase  38.13 
 
 
304 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000358411  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1254  glutaminase  38.13 
 
 
304 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000302254  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1184  glutaminase  38.13 
 
 
304 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000737214  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2697  glutaminase  41.18 
 
 
304 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.718556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3036  glutaminase  41.18 
 
 
304 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103836  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1126  glutaminase  39.58 
 
 
304 aa  192  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0389369  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1328  glutaminase  41.18 
 
 
304 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00785417  hitchhiker  0.00333617 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0147  glutaminase  37.76 
 
 
308 aa  192  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.00000034467 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3050  glutaminase  41.18 
 
 
304 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000590255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0426  glutaminase  35.84 
 
 
309 aa  192  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000693628  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03588  glutaminase  39.3 
 
 
306 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>