48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0618 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
210 aa  420  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  81.99 
 
 
210 aa  333  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  68.81 
 
 
224 aa  247  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  65.82 
 
 
249 aa  238  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0328  putative transcriptional regulator  61.54 
 
 
201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1111  putative transcriptional regulator  65.96 
 
 
223 aa  229  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0673626  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  59.3 
 
 
193 aa  217  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0212  regulatory protein ArsR  59.04 
 
 
201 aa  200  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2299  regulatory protein, ArsR  53.37 
 
 
196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0404  hypothetical protein  53.97 
 
 
197 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.748136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0383  hypothetical protein  53.97 
 
 
197 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0395  hypothetical protein  53.97 
 
 
197 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1399  hypothetical protein  59.07 
 
 
192 aa  171  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.104773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  36.9 
 
 
196 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  35.79 
 
 
205 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0996  hypothetical protein  35.75 
 
 
224 aa  95.1  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2552  ArsR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
185 aa  92  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0674571  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4628  hypothetical protein  34.74 
 
 
200 aa  92  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7611  ArsR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
185 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  26.56 
 
 
150 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
207 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 
207 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
197 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 
142 aa  53.9  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
207 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
207 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
207 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  33.82 
 
 
207 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3275  transcriptional regulator, ArsR family  32.79 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.42483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  42.62 
 
 
171 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 
472 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 
209 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  25.43 
 
 
232 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  51.22 
 
 
196 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
171 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5282  hypothetical protein  29.69 
 
 
180 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  47.17 
 
 
315 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 
89 aa  43.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  45.28 
 
 
119 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  43.4 
 
 
118 aa  42.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  36.36 
 
 
230 aa  42  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  38.98 
 
 
214 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
219 aa  41.6  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0361  hypothetical protein  26.67 
 
 
182 aa  41.6  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  38.98 
 
 
216 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1739  hypothetical protein  30.34 
 
 
149 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0385114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>