34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1399 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1399  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  364  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.104773  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  83.68 
 
 		 193 aa  301  4.0000000000000003e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0328  putative transcriptional regulator  63.5 
 
 		 201 aa  231  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2299  regulatory protein, ArsR  62.18 
 
 		 196 aa  211  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718193  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  59.79 
 
 		 210 aa  210  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  56.02 
 
 		 210 aa  196  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0395  hypothetical protein  56.99 
 
 		 197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0404  hypothetical protein  56.99 
 
 		 197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.748136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0383  hypothetical protein  56.99 
 
 		 197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  55.79 
 
 		 224 aa  167  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  56.06 
 
 		 249 aa  164  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1111  putative transcriptional regulator  52.66 
 
 		 223 aa  161  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0673626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0212  regulatory protein ArsR  50.26 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  42.02 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  37.3 
 
 		 196 aa  107  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4628  hypothetical protein  40.43 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0996  hypothetical protein  41.44 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2552  ArsR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 185 aa  94.7  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0674571  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7611  ArsR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 185 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  29.07 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  38.16 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  26.97 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 207 aa  47.8  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  28.74 
 
 		 472 aa  44.7  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3275  transcriptional regulator, ArsR family  37.1 
 
 		 184 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.42483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 171 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>