41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0212 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0212  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 201 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  68.56 
 
 		 224 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1111  putative transcriptional regulator  67.02 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0673626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  61.26 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  65.96 
 
 		 249 aa  224  7e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  59.04 
 
 		 210 aa  219  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0328  putative transcriptional regulator  57.59 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2299  regulatory protein, ArsR  57.07 
 
 		 196 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718193  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  54.97 
 
 		 193 aa  184  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0395  hypothetical protein  54.59 
 
 		 197 aa  184  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0404  hypothetical protein  54.59 
 
 		 197 aa  184  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.748136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0383  hypothetical protein  54.59 
 
 		 197 aa  184  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1399  hypothetical protein  50.26 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.104773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  36.04 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  40 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4628  hypothetical protein  37.95 
 
 		 200 aa  91.7  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0996  hypothetical protein  37.31 
 
 		 224 aa  89.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2552  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 185 aa  89  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0674571  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7611  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  34.81 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  31.65 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  30.38 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  27.66 
 
 		 142 aa  50.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3275  transcriptional regulator, ArsR family  30.14 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.42483  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 		 243 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  31.97 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  45.28 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  24.3 
 
 		 472 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  36.92 
 
 		 171 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  33.78 
 
 		 209 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  48.89 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.81 
 
 		 213 aa  41.2  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>