More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0059 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0059  ABC-1 domain protein  100 
 
 
545 aa  1078  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.07 
 
 
558 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.91 
 
 
573 aa  273  8e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  31.07 
 
 
558 aa  257  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  30.58 
 
 
558 aa  257  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  31.84 
 
 
558 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.74003e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.99 
 
 
554 aa  253  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  32.08 
 
 
558 aa  253  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  31.46 
 
 
557 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  29.72 
 
 
547 aa  230  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  28.22 
 
 
562 aa  229  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  31.14 
 
 
585 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  31.05 
 
 
578 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  30.11 
 
 
563 aa  223  7e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  28.54 
 
 
582 aa  220  6e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  9.24249e-08  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  30.57 
 
 
557 aa  219  8e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.57 
 
 
557 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1047  protein kinase  33.17 
 
 
525 aa  219  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  28.6 
 
 
559 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  29.78 
 
 
557 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  29.53 
 
 
571 aa  218  3e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  30.87 
 
 
537 aa  216  6e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  30.02 
 
 
555 aa  214  3e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  31.87 
 
 
557 aa  214  4e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  29.28 
 
 
561 aa  213  5e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  27.37 
 
 
563 aa  213  5e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.57 
 
 
559 aa  213  7e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  30.68 
 
 
537 aa  213  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  30.27 
 
 
591 aa  212  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1617  ABC-1 domain protein  31.49 
 
 
547 aa  210  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  29.04 
 
 
556 aa  209  8e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  27.02 
 
 
552 aa  209  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.66 
 
 
558 aa  206  8e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  28.03 
 
 
571 aa  206  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  28.24 
 
 
561 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  27 
 
 
565 aa  205  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.86884e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  30.21 
 
 
582 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  31.24 
 
 
544 aa  205  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0841  ABC-1 domain-containing protein  27.6 
 
 
652 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  28.24 
 
 
584 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  28.85 
 
 
565 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  28.85 
 
 
565 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.92 
 
 
584 aa  204  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  27.54 
 
 
599 aa  203  8e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.84 
 
 
530 aa  201  2e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  27.8 
 
 
582 aa  202  2e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.15 
 
 
561 aa  202  2e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  27.54 
 
 
561 aa  201  2e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  2.98772e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  28.35 
 
 
581 aa  200  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  29.98 
 
 
582 aa  199  1e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.7 
 
 
559 aa  198  2e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  29.25 
 
 
564 aa  198  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.67 
 
 
555 aa  197  5e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  29.58 
 
 
544 aa  196  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  26.51 
 
 
561 aa  196  8e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.09 
 
 
559 aa  196  8e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00564  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.15 
 
 
544 aa  195  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.04 
 
 
551 aa  195  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  29.16 
 
 
562 aa  195  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.51 
 
 
561 aa  194  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  25.74 
 
 
606 aa  193  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0544  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.94 
 
 
544 aa  193  6e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.6 
 
 
549 aa  193  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  28.36 
 
 
560 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  29.95 
 
 
545 aa  191  3e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3375  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.75 
 
 
549 aa  190  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.18 
 
 
521 aa  190  6e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  28.33 
 
 
581 aa  190  6e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  29.07 
 
 
557 aa  190  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.16 
 
 
506 aa  189  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  28.91 
 
 
559 aa  189  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4248  ABC-1 domain protein  29.37 
 
 
553 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00077859  hitchhiker  9.99881e-08 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  28.46 
 
 
558 aa  188  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  28.15 
 
 
560 aa  189  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0525  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.37 
 
 
549 aa  188  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1576  putative kinase  29.15 
 
 
559 aa  187  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02851  putative kinase  28.44 
 
 
541 aa  187  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5644  ABC-1 domain protein  27.25 
 
 
646 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0588147  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4211  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.31 
 
 
544 aa  185  1e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02281  putative kinase  27.76 
 
 
560 aa  186  1e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0799  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.18 
 
 
521 aa  186  1e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  26.33 
 
 
550 aa  185  2e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.9 
 
 
504 aa  185  2e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3794  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.14 
 
 
549 aa  185  2e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.647257  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10840  predicted unusual protein kinase  27.51 
 
 
550 aa  184  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  29.56 
 
 
549 aa  184  4e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2690  ABC-1 domain protein  25.53 
 
 
582 aa  184  4e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.066858  normal  0.0662715 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1098  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.51 
 
 
552 aa  184  4e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2256  ABC-1 domain protein  27.18 
 
 
560 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3641  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.5 
 
 
522 aa  183  9e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.302348  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0870  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.51 
 
 
521 aa  182  9e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216871  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.03 
 
 
549 aa  183  9e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.915437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0429  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.03 
 
 
549 aa  183  9e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  6.73337e-05 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  28.79 
 
 
562 aa  183  9e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  28.79 
 
 
562 aa  183  9e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  27.92 
 
 
557 aa  182  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4245  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.92 
 
 
546 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.806176  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1190  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.48 
 
 
552 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.601295  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.19 
 
 
521 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0459359  normal  0.0103922 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  29.31 
 
 
551 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>