25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0450 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0450  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 		 362 aa  751    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6240  GDSL family lipase  26.67 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8161  lipolytic protein G-D-S-L family  23.64 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  21.78 
 
 		 222 aa  53.1  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  21.98 
 
 		 249 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  26.53 
 
 		 204 aa  52.8  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0173  lipolytic protein G-D-S-L family  23.29 
 
 		 340 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  23.63 
 
 		 213 aa  50.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1034  Sialate O-acetylesterase  23.16 
 
 		 689 aa  47.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2714  lipolytic protein  23.94 
 
 		 200 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345336 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  20 
 
 		 252 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  20.9 
 
 		 593 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19400  hypothetical protein  29.32 
 
 		 392 aa  46.6  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3064  hypothetical protein  24.77 
 
 		 386 aa  46.6  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0823748  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  24.21 
 
 		 204 aa  46.2  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1105  lysophospholipase L1 or related esterase  22.78 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1649  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  26.67 
 
 		 797 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1504  hypothetical protein  38.64 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.232931  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  25 
 
 		 194 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  23.89 
 
 		 255 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0772  GDSL family lipase  22.17 
 
 		 201 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1886  lysophospholipase L1 related esterase  25.77 
 
 		 187 aa  44.3  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143841  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0370  hypothetical protein  25.13 
 
 		 393 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  22.4 
 
 		 234 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3444  arylesterase  23.35 
 
 		 214 aa  42.7  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000206648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>