172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4508 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  100 
 
 
170 aa  326  8e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  70.97 
 
 
116 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  70.97 
 
 
116 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  69.89 
 
 
116 aa  124  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  40.57 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  36.11 
 
 
116 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0167  ribonuclease P  40.66 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00183081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  36.11 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  38.82 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  33.67 
 
 
119 aa  61.6  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  37.5 
 
 
119 aa  61.2  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  37.5 
 
 
119 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  37.5 
 
 
119 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  37.5 
 
 
119 aa  60.8  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  37.5 
 
 
119 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  37.25 
 
 
121 aa  60.8  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  37.5 
 
 
119 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  37.5 
 
 
119 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  32.67 
 
 
115 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  36.79 
 
 
119 aa  60.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  35.29 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  41.76 
 
 
128 aa  60.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  34.12 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  36.47 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  34.91 
 
 
119 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  39.08 
 
 
125 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  38.53 
 
 
123 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3942  ribonuclease P  34.12 
 
 
118 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000139461  unclonable  0.0000000000208872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  34.12 
 
 
118 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000319179  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  34.12 
 
 
118 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000450646  unclonable  0.0000000000397397 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4382  ribonuclease P  34.12 
 
 
118 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000348711  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  37.5 
 
 
119 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  37.5 
 
 
119 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4004  ribonuclease P  34.12 
 
 
118 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4327  ribonuclease P  34.12 
 
 
118 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000794478  unclonable  0.00000000000188803 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  37.5 
 
 
119 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  35.96 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  39.36 
 
 
119 aa  59.7  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  37.5 
 
 
119 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4523  ribonuclease P  34.12 
 
 
118 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021378  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4381  ribonuclease P  34.12 
 
 
118 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000190839  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  37.5 
 
 
119 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  40.66 
 
 
116 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  41.38 
 
 
130 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  37 
 
 
121 aa  58.2  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  36.47 
 
 
120 aa  58.2  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4262  ribonuclease P protein component  40.38 
 
 
108 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117782  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  38.61 
 
 
128 aa  57  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  32.94 
 
 
118 aa  57  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  35.23 
 
 
114 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  38.3 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  43.06 
 
 
118 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4291  ribonuclease P  39.42 
 
 
108 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000762  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  33.96 
 
 
119 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  31.76 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  35.23 
 
 
114 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  35.19 
 
 
120 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  33.03 
 
 
120 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  41.18 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4151  ribonuclease P protein component  37.78 
 
 
108 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747963  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2390  ribonuclease P protein component  29.46 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102633  hitchhiker  0.0000000753131 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  34.48 
 
 
154 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1229  ribonuclease P protein component  39.62 
 
 
122 aa  55.1  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0151351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  29.7 
 
 
117 aa  54.3  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  29.7 
 
 
117 aa  54.3  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2413  ribonuclease P protein component  32.95 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0343106  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4248  ribonuclease P  36.67 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000157593  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  45.9 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  32.35 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  32.35 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  32.18 
 
 
109 aa  52  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  36.9 
 
 
117 aa  52.4  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  35.64 
 
 
123 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  34.31 
 
 
115 aa  52  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  32.35 
 
 
115 aa  52  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  33.67 
 
 
107 aa  52  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  34.48 
 
 
111 aa  52  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  36.36 
 
 
121 aa  52  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  32.99 
 
 
120 aa  52  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  33.67 
 
 
118 aa  52  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  34.31 
 
 
115 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  32.35 
 
 
119 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  32.35 
 
 
119 aa  51.6  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  32.35 
 
 
119 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  32.35 
 
 
119 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  32.18 
 
 
240 aa  51.6  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  32.35 
 
 
119 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  32.26 
 
 
132 aa  51.6  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  39.68 
 
 
128 aa  51.2  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0134  ribonuclease P protein component  27.19 
 
 
115 aa  51.2  0.000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0423414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  34.44 
 
 
180 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  32.35 
 
 
115 aa  50.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  36.84 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000166605  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  29.29 
 
 
116 aa  50.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  32.94 
 
 
118 aa  49.7  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4016  ribonuclease P protein component  34.15 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0116419  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  38.46 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  35.23 
 
 
119 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  38.05 
 
 
119 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3897  ribonuclease P protein component  32.17 
 
 
132 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>