175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1162 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1162  Threonine aldolase  100 
 
 
345 aa  713    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0635  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  60.41 
 
 
344 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.538663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2181  threonine aldolase  56.3 
 
 
346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0421215  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0005  L-threonine aldolase, low-specificity  52.96 
 
 
351 aa  367  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1081  Threonine aldolase  53.49 
 
 
344 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00175946  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08120  L-threonine aldolase  52.91 
 
 
344 aa  359  4e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000672977  hitchhiker  0.0000000548027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7125  Threonine aldolase  48.68 
 
 
339 aa  328  9e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0883  hypothetical protein  48.52 
 
 
341 aa  325  5e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0474  low-specificity L-threonine aldolase  49.4 
 
 
345 aa  323  2e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1377  hypothetical protein  47.04 
 
 
351 aa  320  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1404  hypothetical protein  47.04 
 
 
351 aa  320  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.265494  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1756  hypothetical protein  44.21 
 
 
341 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2927  Threonine aldolase  48.1 
 
 
345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0857  threonine aldolase  44.08 
 
 
341 aa  296  4e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0102  Threonine aldolase  43.15 
 
 
342 aa  282  5.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04194  threonine aldolase  50.18 
 
 
282 aa  276  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0904  threonine aldolase  40.41 
 
 
350 aa  250  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000336158  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0300  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.13 
 
 
337 aa  218  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1286  threonine aldolase  33.05 
 
 
340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.78945  normal  0.413936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1657  L-threonine aldolase  34.75 
 
 
339 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.789065  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0572  Threonine aldolase  33.82 
 
 
341 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0393816 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0686  L-threonine aldolase  34.83 
 
 
352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.813644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4886  threonine aldolase  34.1 
 
 
346 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.694097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0321  threonine aldolase  33.24 
 
 
346 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000281363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0343  threonine aldolase  33.24 
 
 
346 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0344  threonine aldolase  32.95 
 
 
346 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4021  threonine aldolase  33.72 
 
 
350 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01000  L-threonine aldolase  32.66 
 
 
357 aa  156  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1651  Threonine aldolase  33.14 
 
 
365 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000248071 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0921  Threonine aldolase  32.54 
 
 
350 aa  153  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1179  threonine aldolase  28.61 
 
 
343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191301  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1658  L-threonine aldolase  32.65 
 
 
362 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3408  L-threonine aldolase, low-specificity  29.89 
 
 
351 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0410  threonine aldolase, low-specificity  31.23 
 
 
346 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1928  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  30.35 
 
 
352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3333  Threonine aldolase  30.57 
 
 
347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4955  L-threonine aldolase  30.21 
 
 
346 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4134  L-threonine aldolase  31.53 
 
 
346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000248279  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4766  threonine aldolase  30.66 
 
 
346 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1870  threonine aldolase  30.17 
 
 
355 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.163709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9381  Threonine aldolase  31.47 
 
 
352 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2289  Threonine aldolase  29.86 
 
 
353 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000548444 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3121  threonine aldolase  31.16 
 
 
346 aa  143  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021379  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1610  threonine aldolase  29.72 
 
 
343 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1475  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  31.09 
 
 
356 aa  142  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71440  low specificity l-threonine aldolase  31.96 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000654342  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2821  Threonine aldolase  29.43 
 
 
343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3442  Threonine aldolase  30.88 
 
 
346 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2555  Threonine aldolase  31.02 
 
 
352 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913127  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0942  L-threonine aldolase  30.92 
 
 
361 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1003  Threonine aldolase  31.21 
 
 
361 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1000  Threonine aldolase  31.21 
 
 
371 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5210  L-threonine aldolase  30.09 
 
 
346 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5537  threonine aldolase  32.27 
 
 
348 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145661  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6201  low specificity l-threonine aldolase  31.67 
 
 
346 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0230725  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2606  threonine aldolase  28.82 
 
 
346 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143153  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1314  L-threonine aldolase  29.73 
 
 
343 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341483  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1982  Threonine aldolase  30.99 
 
 
351 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0880  L-threonine aldolase  30.61 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0859  L-threonine aldolase  29.18 
 
 
346 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5175  Threonine aldolase  30.32 
 
 
359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3318  Threonine aldolase  29.46 
 
 
346 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5568  Threonine aldolase  30.95 
 
 
353 aa  132  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0809  L-threonine aldolase  27.76 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4532  Threonine aldolase  30.41 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.334548  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5153  threonine aldolase  29.59 
 
 
374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0983  threonine aldolase  31.45 
 
 
348 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00961292  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4433  threonine aldolase  29.6 
 
 
353 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0824  Threonine aldolase  28 
 
 
348 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3503  L-threonine aldolase  28.86 
 
 
353 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0754  Threonine aldolase  28 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0601486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0329  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  28.17 
 
 
375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1898  Threonine aldolase  29.77 
 
 
375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2745  L-threonine aldolase  30.41 
 
 
352 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1236  threonine aldolase  31.07 
 
 
368 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0865335 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1555  threonine aldolase  29.51 
 
 
364 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.746494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5263  L-threonine aldolase  31.44 
 
 
358 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5352  L-threonine aldolase  31.44 
 
 
358 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5642  L-threonine aldolase  31.44 
 
 
358 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05504  putative low specificity L-threonine aldolase protein  28.4 
 
 
365 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.264443 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0808  low specificity L-threonine aldolase protein  29.75 
 
 
345 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0678  Threonine aldolase  29.33 
 
 
362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1430  L-threonine aldolase  30.98 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1966  threonine aldolase  26.98 
 
 
345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30040  L-threonine aldolase  27.71 
 
 
353 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2249  L-threonine aldolase  29.77 
 
 
349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3617  Threonine aldolase  28.32 
 
 
350 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1646  L-threonine aldolase  27.51 
 
 
349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3664  threonine aldolase  28.49 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0977  threonine aldolase  26.45 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1277  Threonine aldolase  28.45 
 
 
357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3736  threonine aldolase  28.41 
 
 
348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2153  L-threonine aldolase  27.38 
 
 
338 aa  109  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.708772  normal  0.227327 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4278  threonine aldolase  30.41 
 
 
349 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431757  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2014  Threonine aldolase  26.36 
 
 
351 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316829  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1844  threonine aldolase  26.5 
 
 
355 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.95316  normal  0.0155245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3318  Threonine aldolase  27.38 
 
 
350 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.410103  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2302  L-threonine aldolase  26.45 
 
 
341 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1176  L-threonine aldolase  30.84 
 
 
340 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3876  Threonine aldolase  26.5 
 
 
350 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.533395 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>