58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1244 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1244  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
404 aa  787    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1245  lipolytic protein G-D-S-L family  80.79 
 
 
414 aa  595  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2556  lipolytic protein G-D-S-L family  46.63 
 
 
414 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2273  lipolytic protein G-D-S-L family  41.59 
 
 
420 aa  282  9e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4089  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2664  GDSL family lipase  40.52 
 
 
423 aa  275  8e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  decreased coverage  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3984  lipolytic protein G-D-S-L family  46.38 
 
 
430 aa  273  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.767273  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14350  lysophospholipase L1-like esterase  45.19 
 
 
407 aa  272  9e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2481  GDSL family lipase  40.69 
 
 
450 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2328  lipolytic protein G-D-S-L family  42.86 
 
 
429 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  0.694344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1831  GDSL family lipase  41.92 
 
 
418 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1567  GDSL-like lipase/acylhydrolase family protein  42.71 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130924  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23690  putative secreted protein  40.98 
 
 
442 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903335 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7004  GDSL family lipase  39.36 
 
 
416 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3096  lipase/acylhydrolase, putative  42 
 
 
428 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  37.14 
 
 
542 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0961  GDSL family lipase  40.65 
 
 
439 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2643  lipolytic protein G-D-S-L family  40.31 
 
 
377 aa  243  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624519  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3061  GDSL family lipase  38.42 
 
 
415 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20820  Lipolytic enzyme, G-D-S-L domain protein  40.75 
 
 
451 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6463  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2856  GDSL family lipase  38.24 
 
 
452 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000379569  hitchhiker  0.00852131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2776  lipolytic protein G-D-S-L family  40.19 
 
 
487 aa  237  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3835  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  39.44 
 
 
425 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00947114  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2571  lipase/acylhydrolase, putative  39.44 
 
 
425 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000716305  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1986  putative lipase/acylhydrolase  39.44 
 
 
425 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000018938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3539  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  39.44 
 
 
425 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000245982  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0013  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.44 
 
 
483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000198  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3110  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  39.44 
 
 
483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.000000000002324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  40.66 
 
 
794 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624872  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0006  lipase/acylhydrolase, putative  41 
 
 
425 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000023586  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0233  GDSL family lipase  40.94 
 
 
421 aa  229  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000340097  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2528  GDSL family lipase  38.5 
 
 
437 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.744163 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1595  lipolytic protein G-D-S-L family  39.31 
 
 
418 aa  226  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3879  GDSL family lipase  31.68 
 
 
414 aa  222  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4719  lipolytic protein G-D-S-L family  36.7 
 
 
407 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0250  GDSL family lipase  38.42 
 
 
421 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000480307  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0259  GDSL family lipase  39.24 
 
 
423 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000511681  normal  0.138993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3482  lipolytic protein G-D-S-L family  37.5 
 
 
409 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0964  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.06 
 
 
407 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263974  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0297  lipase/acylhydrolase  37.41 
 
 
423 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223769  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4791  lipolytic protein G-D-S-L family  38.02 
 
 
422 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0311  GDSL family lipase  39.65 
 
 
421 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000971594  hitchhiker  0.00755719 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3660  lipolytic protein G-D-S-L family  39.09 
 
 
422 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000531698  hitchhiker  0.0000015866 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0331  GDSL family lipase  39.39 
 
 
421 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381329  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2775  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.39 
 
 
421 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000857041  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3430  lipolytic protein  39.14 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000013234  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0775  lipolytic protein G-D-S-L family  36.64 
 
 
646 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812985  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3774  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.81 
 
 
384 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000241856  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4331  hypothetical protein  39.05 
 
 
326 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46242  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09287  extracellular GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00820)  31.5 
 
 
425 aa  172  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.879656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2832  lipolytic protein G-D-S-L family  35.51 
 
 
396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000255461  decreased coverage  0.0000190518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2070  lipolytic protein G-D-S-L family  32.98 
 
 
395 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397214  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0237  hypothetical protein  24.44 
 
 
376 aa  146  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3614  lipolytic protein G-D-S-L family  38.57 
 
 
220 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2838  lipolytic protein G-D-S-L family  27.82 
 
 
399 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.902078  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  27.79 
 
 
1375 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  25.97 
 
 
252 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  29.46 
 
 
728 aa  46.6  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3633  hypothetical protein  34.18 
 
 
226 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>