24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3633 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3633  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3984  lipolytic protein G-D-S-L family  37.8 
 
 		 430 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.767273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14350  lysophospholipase L1-like esterase  40.85 
 
 		 407 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2643  lipolytic protein G-D-S-L family  52 
 
 		 377 aa  52.4  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4791  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 		 422 aa  52  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2528  GDSL family lipase  38.81 
 
 		 437 aa  52  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2776  lipolytic protein G-D-S-L family  37.93 
 
 		 487 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1567  GDSL-like lipase/acylhydrolase family protein  28.34 
 
 		 422 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  37.5 
 
 		 542 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3061  GDSL family lipase  42.11 
 
 		 415 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1595  lipolytic protein G-D-S-L family  41.67 
 
 		 418 aa  49.3  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23690  putative secreted protein  33.82 
 
 		 442 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00903335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20820  Lipolytic enzyme, G-D-S-L domain protein  38.71 
 
 		 451 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6463  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2273  lipolytic protein G-D-S-L family  32.89 
 
 		 420 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0961  GDSL family lipase  36.21 
 
 		 439 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1244  lipolytic protein G-D-S-L family  34.18 
 
 		 404 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7004  GDSL family lipase  39.39 
 
 		 416 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1831  GDSL family lipase  47.17 
 
 		 418 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1245  lipolytic protein G-D-S-L family  39.39 
 
 		 414 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2481  GDSL family lipase  42.59 
 
 		 450 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4719  lipolytic protein G-D-S-L family  45 
 
 		 407 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4331  hypothetical protein  41.46 
 
 		 326 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46242  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2664  GDSL family lipase  38.96 
 
 		 423 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  decreased coverage  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3482  lipolytic protein G-D-S-L family  35.82 
 
 		 409 aa  42  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>