117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0083 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0083  arginine deiminase  100 
 
 
415 aa  824  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00980  arginine deiminase  78.63 
 
 
418 aa  612  1e-174  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4362  arginine deiminase  72.15 
 
 
399 aa  562  1e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0268184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4655  arginine deiminase  72.15 
 
 
399 aa  562  1e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4276  arginine deiminase  72.15 
 
 
399 aa  562  1e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1923  arginine deiminase  70.71 
 
 
402 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849208  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1483  arginine deiminase  69.95 
 
 
417 aa  540  1e-152  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4810  arginine deiminase  70.45 
 
 
402 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0096  Arginine deiminase  68.34 
 
 
397 aa  516  1e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6447  Arginine deiminase  68.18 
 
 
401 aa  513  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11020  arginine deiminase  67.17 
 
 
402 aa  500  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00481648  normal  0.252626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0245  Arginine deiminase  67.09 
 
 
407 aa  495  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0166  arginine deiminase  64.76 
 
 
407 aa  493  1e-138  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4517  arginine deiminase  63.98 
 
 
419 aa  477  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5027  arginine deiminase  63.82 
 
 
436 aa  471  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03644  arginine deiminase  45.64 
 
 
406 aa  336  6e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002421  arginine deiminase  45.11 
 
 
406 aa  327  2e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2175  arginine deiminase  45.97 
 
 
407 aa  323  4e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4646  arginine deiminase  44.33 
 
 
408 aa  322  1e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4751  arginine deiminase  45.61 
 
 
406 aa  321  2e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4721  arginine deiminase  45.36 
 
 
406 aa  320  4e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.160752 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4850  arginine deiminase  45.61 
 
 
406 aa  320  4e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4869  arginine deiminase  45.61 
 
 
406 aa  320  4e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99557  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4814  arginine deiminase  45.61 
 
 
406 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.514213  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0452  arginine deiminase  45.61 
 
 
406 aa  319  5e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0154087 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0521  arginine deiminase  42.36 
 
 
406 aa  313  4e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2241  arginine deiminase  43.6 
 
 
408 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.420551  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2842  arginine deiminase  45.25 
 
 
407 aa  309  7e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5911  arginine deiminase  41.28 
 
 
418 aa  307  2e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68330  arginine deiminase  41.28 
 
 
418 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0305167  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0146  Arginine deiminase  43.21 
 
 
418 aa  301  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.152156  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2384  arginine deiminase  41.36 
 
 
418 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0915  arginine deiminase  40.05 
 
 
425 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.199485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1987  arginine deiminase  40.05 
 
 
425 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1968  arginine deiminase  40.05 
 
 
425 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1585  arginine deiminase  40.05 
 
 
425 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593064  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5202  arginine deiminase  42.18 
 
 
409 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1993  arginine deiminase  43 
 
 
409 aa  300  4e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0244  arginine deiminase  40.88 
 
 
418 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.177329  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1145  arginine deiminase  40.88 
 
 
418 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2128  arginine deiminase  40.88 
 
 
418 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853233  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4537  arginine deiminase  40.19 
 
 
418 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130916  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0483  arginine deiminase  38.94 
 
 
408 aa  296  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  4.67571e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5575  arginine deiminase  44.03 
 
 
405 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1877  arginine deiminase  44.17 
 
 
405 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6443  arginine deiminase  39.9 
 
 
417 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1090  arginine deiminase  39.41 
 
 
419 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2800  Arginine deiminase  42.65 
 
 
414 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1108  arginine deiminase  40.54 
 
 
416 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0058  arginine deiminase  38.02 
 
 
407 aa  289  7e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4223  arginine deiminase  41.18 
 
 
417 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5730  Arginine deiminase  43.54 
 
 
434 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0420  arginine deiminase  40.44 
 
 
410 aa  287  3e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4898  arginine deiminase  40.44 
 
 
410 aa  287  3e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12360  arginine deiminase  44.64 
 
 
410 aa  285  1e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0472  arginine deiminase  40.2 
 
 
410 aa  285  1e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0348  arginine deiminase  39.8 
 
 
410 aa  283  3e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1001  arginine deiminase  40.44 
 
 
417 aa  283  3e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1038  arginine deiminase  40.44 
 
 
417 aa  283  4e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0407  arginine deiminase  39.8 
 
 
410 aa  283  5e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.751468 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0341  arginine deiminase  39.8 
 
 
410 aa  283  5e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1975  arginine deiminase  39.8 
 
 
413 aa  282  8e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06650  arginine deiminase  39.55 
 
 
410 aa  282  9e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.22198e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1000  arginine deiminase  40.59 
 
 
419 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1118  arginine deiminase  38.81 
 
 
414 aa  278  1e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00592031  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06020  arginine deiminase  44.91 
 
 
409 aa  275  1e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2684  arginine deiminase  38.12 
 
 
418 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4386  arginine deiminase  39.07 
 
 
418 aa  273  4e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252294  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2250  arginine deiminase  38.59 
 
 
411 aa  269  7e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3978  Arginine deiminase  40.59 
 
 
419 aa  269  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103807  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0432  arginine deiminase  40.2 
 
 
409 aa  269  9e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.277961  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22360  arginine deiminase  39.45 
 
 
406 aa  265  9e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1457  arginine deiminase  39.47 
 
 
410 aa  265  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00237571  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1949  arginine deiminase  37.91 
 
 
405 aa  263  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  4.74348e-05  normal  0.297072 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2659  arginine deiminase  38.2 
 
 
411 aa  263  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2715  arginine deiminase  38.2 
 
 
411 aa  263  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3384  amidinotransferase  37.88 
 
 
410 aa  263  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1391  arginine deiminase  39.52 
 
 
417 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00832109  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0153  arginine deiminase  37.75 
 
 
405 aa  262  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0902  arginine deiminase  36.43 
 
 
406 aa  261  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0445  arginine deiminase  37.93 
 
 
410 aa  261  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.29267e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2163  arginine deiminase  37.38 
 
 
410 aa  259  5e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0451  arginine deiminase  37.81 
 
 
410 aa  259  6e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131772  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01620  arginine deiminase  40.2 
 
 
407 aa  258  1e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  8.11385e-07 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06540  arginine deiminase  39.95 
 
 
407 aa  257  3e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00222308  normal  0.406316 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0746  arginine deiminase  40.65 
 
 
407 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0880775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2424  arginine deiminase  40.34 
 
 
431 aa  252  9e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0181  Arginine deiminase  38 
 
 
405 aa  249  5e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0258  Arginine deiminase  35.14 
 
 
401 aa  249  6e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0161  arginine deiminase  39.33 
 
 
413 aa  246  5e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0157  arginine deiminase  38.94 
 
 
413 aa  244  2e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0089  arginine deiminase  37.87 
 
 
403 aa  243  5e-63  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02360  arginine deiminase  36.98 
 
 
417 aa  230  4e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0263165  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0871  arginine deiminase  33.5 
 
 
410 aa  225  9e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0203728  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07960  arginine deiminase  34.84 
 
 
403 aa  214  2e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.86602e-06 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf873  arginine deiminase  31.76 
 
 
409 aa  187  2e-46  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2490  Arginine deiminase  33.26 
 
 
420 aa  186  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0565  Arginine deiminase  32.47 
 
 
453 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0874  arginine deiminase  28.18 
 
 
377 aa  139  7e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0192  Arginine deiminase  26.38 
 
 
501 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>