More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0932 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0932  YceI  100 
 
 
183 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  93.99 
 
 
183 aa  353  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  93.99 
 
 
183 aa  351  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  76.8 
 
 
182 aa  291  5e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  80.47 
 
 
182 aa  290  6e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  62.22 
 
 
182 aa  229  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  56.25 
 
 
182 aa  205  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  53.41 
 
 
187 aa  194  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  54.07 
 
 
196 aa  193  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  51.43 
 
 
177 aa  192  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  53.67 
 
 
188 aa  191  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  53.85 
 
 
183 aa  190  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  55.88 
 
 
187 aa  185  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  52.57 
 
 
197 aa  184  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  52.57 
 
 
197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  51.98 
 
 
186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  50.28 
 
 
182 aa  178  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  52.78 
 
 
223 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  48.86 
 
 
176 aa  175  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  52.22 
 
 
201 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  47.46 
 
 
177 aa  174  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  52.22 
 
 
201 aa  174  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  51.11 
 
 
214 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  51.12 
 
 
201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  48.57 
 
 
189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  48.55 
 
 
219 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  51.12 
 
 
201 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  50.88 
 
 
201 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  49.71 
 
 
181 aa  171  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  50 
 
 
195 aa  171  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  44 
 
 
174 aa  170  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  50.59 
 
 
201 aa  169  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  50 
 
 
201 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  47.95 
 
 
196 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  45.76 
 
 
177 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  48.57 
 
 
182 aa  168  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  49.41 
 
 
186 aa  169  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  49.71 
 
 
181 aa  168  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  50.89 
 
 
181 aa  168  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  49.46 
 
 
200 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  49.14 
 
 
187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  47.37 
 
 
180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  50.59 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  48.8 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  49.71 
 
 
190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  46.24 
 
 
198 aa  161  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  42.61 
 
 
182 aa  161  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  46.82 
 
 
204 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  45.93 
 
 
185 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  45.88 
 
 
285 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  49.7 
 
 
183 aa  159  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  41.38 
 
 
187 aa  156  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  43.79 
 
 
188 aa  155  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  44.38 
 
 
182 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  42.37 
 
 
177 aa  155  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  47.34 
 
 
181 aa  155  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  47.95 
 
 
183 aa  155  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  47.06 
 
 
199 aa  155  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  42.44 
 
 
175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  43.43 
 
 
183 aa  154  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  41.71 
 
 
175 aa  154  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  46.78 
 
 
182 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  46.78 
 
 
182 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  46.78 
 
 
182 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  46.41 
 
 
187 aa  153  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  44.77 
 
 
181 aa  152  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  47.06 
 
 
175 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  43.58 
 
 
178 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  43.68 
 
 
182 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07170  hypothetical protein  45.56 
 
 
181 aa  148  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  40 
 
 
182 aa  147  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  44.32 
 
 
181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  45.35 
 
 
175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  45.12 
 
 
195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  47.02 
 
 
176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  41.95 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  42.11 
 
 
181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  43.02 
 
 
184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  39.29 
 
 
192 aa  143  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  42.39 
 
 
196 aa  143  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  43.9 
 
 
178 aa  141  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  40.68 
 
 
194 aa  141  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  40.8 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  40.12 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  43.86 
 
 
183 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  45.99 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  42.86 
 
 
180 aa  138  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  41.28 
 
 
191 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  40.61 
 
 
176 aa  136  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  36.21 
 
 
180 aa  136  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  43.11 
 
 
193 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  40.12 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  40.85 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  45.93 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  40.24 
 
 
191 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  40.85 
 
 
192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  40.24 
 
 
191 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  40.24 
 
 
191 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  40.24 
 
 
191 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  41.82 
 
 
191 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>