More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4087 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4087  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  100 
 
 
1110 aa  2241    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
1479 aa  201  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  26.47 
 
 
945 aa  183  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 
1415 aa  181  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.79 
 
 
863 aa  173  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.94 
 
 
662 aa  173  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  35.02 
 
 
565 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  36.46 
 
 
613 aa  169  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.05 
 
 
598 aa  168  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  37.79 
 
 
646 aa  166  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.04 
 
 
880 aa  165  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  36.73 
 
 
1435 aa  164  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  34.47 
 
 
638 aa  164  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  28.72 
 
 
662 aa  159  4e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  33.45 
 
 
889 aa  159  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.84 
 
 
1044 aa  157  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  36.02 
 
 
593 aa  156  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  32.1 
 
 
537 aa  156  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  31.95 
 
 
651 aa  154  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.34 
 
 
798 aa  153  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.58 
 
 
822 aa  152  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.21 
 
 
650 aa  152  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.26 
 
 
620 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.25 
 
 
591 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.95 
 
 
635 aa  150  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  30.8 
 
 
692 aa  150  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  34.19 
 
 
519 aa  149  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  35.84 
 
 
636 aa  148  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.77 
 
 
584 aa  148  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  36.94 
 
 
653 aa  148  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  38.15 
 
 
626 aa  148  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 
888 aa  148  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3789  serine/threonine protein kinase  34.44 
 
 
563 aa  147  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3775  protein kinase  34.42 
 
 
488 aa  147  9e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
612 aa  147  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.58 
 
 
667 aa  147  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 
666 aa  146  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
612 aa  146  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  32.96 
 
 
614 aa  146  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.06 
 
 
632 aa  146  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3883  serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 
344 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 
891 aa  146  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0362  serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 
632 aa  145  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  32.01 
 
 
455 aa  145  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0171  serine/threonine protein kinase  37.21 
 
 
575 aa  145  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.495174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.34 
 
 
943 aa  145  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  35.02 
 
 
468 aa  145  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  36.4 
 
 
658 aa  145  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  31.92 
 
 
621 aa  144  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.23 
 
 
641 aa  144  8e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
557 aa  144  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  33.83 
 
 
528 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0491  serine/threonine protein kinase  31.12 
 
 
1070 aa  144  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.424967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0510  serine/threonine protein kinase  33.81 
 
 
661 aa  144  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 
650 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1820  serine/threonine protein kinase  33.64 
 
 
451 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.672727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.74 
 
 
511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.37 
 
 
757 aa  142  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1202  serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 
695 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0753061  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.68 
 
 
653 aa  142  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.93 
 
 
916 aa  142  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 
862 aa  142  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3707  serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 
480 aa  142  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3790  serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 
487 aa  142  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000242747  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  36.94 
 
 
565 aa  142  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0884  serine/threonine protein kinase  35.98 
 
 
636 aa  141  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  34.42 
 
 
1057 aa  142  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  33.68 
 
 
915 aa  141  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0335  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.48 
 
 
476 aa  141  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5188  serine/threonine protein kinase  33.82 
 
 
625 aa  141  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2040  serine/threonine protein kinase  35.42 
 
 
451 aa  141  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00475654  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0036  serine/threonine protein kinase  37.95 
 
 
614 aa  141  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 
938 aa  141  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 
700 aa  141  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 
894 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.68 
 
 
658 aa  140  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.08 
 
 
769 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2110  serine/threonine protein kinase  35.07 
 
 
451 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  34.07 
 
 
574 aa  140  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0047  protein kinase  34.21 
 
 
462 aa  140  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576125  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4569  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.21 
 
 
655 aa  140  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.967984  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  34.29 
 
 
1053 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4988  serine/threonine protein kinase  33.11 
 
 
773 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0218503  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6755  serine/threonine protein kinase  31.99 
 
 
597 aa  140  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2518  serine/threonine protein kinase  38.06 
 
 
505 aa  140  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5101  serine/threonine protein kinase  32.6 
 
 
996 aa  140  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0026  serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 
444 aa  140  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  35.32 
 
 
484 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00190  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 
663 aa  139  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.13 
 
 
681 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.76 
 
 
1023 aa  139  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.3 
 
 
445 aa  139  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  31.76 
 
 
615 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.65 
 
 
627 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.83 
 
 
579 aa  139  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  30.68 
 
 
457 aa  139  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.58 
 
 
645 aa  139  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1254  serine/threonine protein kinase  34.42 
 
 
522 aa  139  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  31 
 
 
325 aa  139  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.45 
 
 
740 aa  138  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>