40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0937 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  410  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3745  putative transmembrane protein  41.94 
 
 
200 aa  119  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0394509  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  37.57 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  36.77 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  37.93 
 
 
180 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  34.1 
 
 
178 aa  98.2  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  35.76 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0901  putative transmembrane protein  37.67 
 
 
178 aa  95.5  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0767133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1551  hypothetical protein  32.47 
 
 
217 aa  95.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  32.96 
 
 
179 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  30.87 
 
 
184 aa  89  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  32.37 
 
 
183 aa  88.6  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  34.53 
 
 
146 aa  87  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0778  putative transmembrane protein  34.25 
 
 
199 aa  85.5  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  31.79 
 
 
177 aa  85.1  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3849  hypothetical protein  30.49 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  30.07 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  32.37 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  28.66 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  25.34 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1282  hypothetical protein  24.62 
 
 
186 aa  61.6  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0768  hypothetical protein  26.88 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01895  putative transmembrane protein  33.77 
 
 
188 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0216755  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5256  hypothetical protein  26.88 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.631222  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  26.35 
 
 
185 aa  52  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0643  hypothetical protein  26.12 
 
 
235 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817874  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4467  putative transmembrane protein  28.47 
 
 
190 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00546453  normal  0.335651 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4601  putative transmembrane protein  28.47 
 
 
190 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0346452  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3482  hypothetical protein  26.04 
 
 
220 aa  48.5  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0571375  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4437  hypothetical protein  24.24 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000924263 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4957  hypothetical protein  23.48 
 
 
235 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05846  hypothetical protein  23.61 
 
 
179 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3616  hypothetical protein  23.13 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2244  hypothetical protein  23.13 
 
 
216 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.28842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1591  Maf-like protein  21.98 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0880448  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3339  hypothetical protein  25 
 
 
174 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0239  hypothetical protein  23.53 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.469269  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5028  hypothetical protein  25 
 
 
265 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.966496  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49880  hypothetical protein  23.88 
 
 
190 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5029  putative transmembrane protein  22.83 
 
 
176 aa  41.6  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.313273  normal  0.903322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>