94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1085 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1085  thiol:disulfide interchange domain protein  100 
 
 
274 aa  565  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00153173  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1547  hypothetical protein  33.46 
 
 
283 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116305 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1872  thiol:disulfide interchange protein, putative  34.5 
 
 
255 aa  110  2e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2787  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  31.36 
 
 
254 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.856388  normal  0.976704 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1397  Fis family transcriptional regulator  29.36 
 
 
272 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3803  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.99 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2560  hypothetical protein  34.55 
 
 
302 aa  99.4  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2947  thiol:disulfide interchange protein DsbG, putative  34.55 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1627  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.02 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4237  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.88 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.919377  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4182  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.54 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2762  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.05 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194838  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2594  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.43 
 
 
255 aa  89.7  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67724  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.79 
 
 
248 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.62 
 
 
276 aa  89.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0765  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.02 
 
 
248 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3534  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.62 
 
 
286 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.31 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347111  normal  0.0253122 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.28 
 
 
268 aa  87  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3020  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.28 
 
 
248 aa  87  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0656  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.28 
 
 
248 aa  87  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0690  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.28 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.678233  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3039  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.28 
 
 
248 aa  87  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00562  hypothetical protein  28.28 
 
 
247 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0306036  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4241  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.23 
 
 
268 aa  86.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2396  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.1 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  2.5188e-05  hitchhiker  2.23583e-05 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00573  periplasmic disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.28 
 
 
253 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.023443  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2396  thiol:disulfide interchange protein  30.53 
 
 
280 aa  84.7  1e-15  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.903284  normal  0.517846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3938  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.31 
 
 
249 aa  80.5  2e-14  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450979  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2031  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.04 
 
 
253 aa  80.9  2e-14  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0704  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.88 
 
 
248 aa  80.5  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  0.0618042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0646  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.69 
 
 
248 aa  80.9  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0660  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.45 
 
 
268 aa  79.7  4e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0719  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.45 
 
 
268 aa  79.7  5e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1355  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  34.04 
 
 
257 aa  78.6  9e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617458  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2228  hypothetical protein  32.35 
 
 
208 aa  72.8  5e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05940  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  24.68 
 
 
257 aa  67.8  2e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  1.39676e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5854  protein-disulfide isomerase-like protein  29.85 
 
 
333 aa  67.4  2e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1943  dsbG domain protein  29.71 
 
 
225 aa  65.1  1e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209968  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1615  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  31.16 
 
 
178 aa  65.1  1e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2299  hypothetical protein  34.65 
 
 
399 aa  64.3  2e-09  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.441757  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1018  thiol:disulfide interchange domain protein  31.58 
 
 
182 aa  62.8  5e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.977804  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0452  hypothetical protein  35.48 
 
 
203 aa  62.8  6e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.912774  hitchhiker  0.000257257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0275  thiol:disulfide interchange domain protein  35.48 
 
 
203 aa  62.8  6e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1057  hypothetical protein  25.41 
 
 
222 aa  60.8  2e-08  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  4.13495e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2246  dsbG domain protein  28.91 
 
 
201 aa  58.5  1e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1896  hypothetical protein  28.91 
 
 
201 aa  58.5  1e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.649573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  25.84 
 
 
246 aa  56.6  4e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4214  hypothetical protein  23.44 
 
 
301 aa  55.8  7e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  7.1573e-05  normal  0.744992 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1066  thiol:disulfide interchange protein  24.61 
 
 
261 aa  55.1  1e-06  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  6.488e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.73 
 
 
236 aa  52.4  8e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  23.73 
 
 
236 aa  52.4  8e-06  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  30 
 
 
241 aa  50.8  2e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  25 
 
 
237 aa  50.8  2e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.84 
 
 
240 aa  51.2  2e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  22.7 
 
 
237 aa  50.1  4e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2292  hypothetical protein  35.29 
 
 
413 aa  49.7  5e-05  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1853  Fis family transcriptional regulator  27.07 
 
 
201 aa  49.3  6e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70818 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0514  thiol:disulfide interchange protein DsbG  29.66 
 
 
122 aa  48.9  8e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  29.29 
 
 
241 aa  49.3  8e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.16 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2559  hypothetical protein  29.03 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.948214  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0985  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.86 
 
 
262 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  26 
 
 
242 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2157  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.68 
 
 
265 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  23.32 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  24.44 
 
 
248 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  29.17 
 
 
241 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  23.2 
 
 
235 aa  46.2  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  24.44 
 
 
248 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1075  hypothetical protein  23.2 
 
 
372 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00702033  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3850  hypothetical protein  22.02 
 
 
354 aa  45.8  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  23.27 
 
 
248 aa  45.8  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  26 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  26 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  25.95 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  30.47 
 
 
249 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  25.5 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  25.5 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  25.5 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.24 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.24 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.24 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.24 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  29.92 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.24 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  26.24 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.8 
 
 
210 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.73 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.24 
 
 
245 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.24 
 
 
245 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  25 
 
 
242 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.24 
 
 
241 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  21.71 
 
 
237 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>