23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0086 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0088  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  277  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.713807  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0086  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  277  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0407  hypothetical protein  47.06 
 
 
165 aa  137  4e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337339  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1902  hypothetical protein  50 
 
 
137 aa  128  2e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00660694  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1709  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 
147 aa  73.2  1e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.567805  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2717  hypothetical protein  40.19 
 
 
140 aa  70.5  8e-12  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  36.52 
 
 
151 aa  63.9  7e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4992  hypothetical protein  31.29 
 
 
154 aa  57.4  6e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3076  hypothetical protein  27.46 
 
 
142 aa  52  3e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.130003  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0062  hypothetical protein  29.17 
 
 
139 aa  51.6  3e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506925  normal  0.544054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3018  hypothetical protein  36.3 
 
 
144 aa  51.2  5e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318191  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13202  hypothetical protein  35.56 
 
 
144 aa  50.8  6e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00935579  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2207  hypothetical protein  35.65 
 
 
147 aa  50.4  9e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0485116  normal  0.147084 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0230  PilT domain-containing protein  28.28 
 
 
145 aa  47.8  5e-05  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.874187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0894  hypothetical protein  29.93 
 
 
143 aa  47.8  5e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0890  hypothetical protein  31.21 
 
 
148 aa  47.8  5e-05  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.416652  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13442  hypothetical protein  30 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0424  PilT domain-containing protein  29.66 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.437549  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2877  PilT protein-like  31.62 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.013961  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3382  PilT protein domain protein  36.03 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0206  hypothetical protein  30.71 
 
 
154 aa  41.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00358255  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1327  hypothetical protein  31.08 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.668385 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0369  hypothetical protein  30 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.126404  normal  0.0369519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>