27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0082 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0082  Rhomboid family protein  100 
 
 		 246 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0070  Rhomboid family protein  99.59 
 
 		 246 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.645934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0064  rhomboid-like protein  97.97 
 
 		 246 aa  421  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646008  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0066  rhomboid family protein  50.41 
 
 		 244 aa  224  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167584  normal  0.0382417 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  22.86 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1913  hypothetical protein  25.78 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312193  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  23.81 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  24.09 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08350  hypothetical protein  25.57 
 
 		 265 aa  49.3  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  22.03 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  30.57 
 
 		 200 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1426  hypothetical protein  27.71 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  22.6 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  31.39 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  29.25 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  22.63 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  24.79 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0617  hypothetical protein  28.33 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  24.66 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  24.82 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0139  hypothetical protein  27.84 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  23.97 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2901  hypothetical protein  22.22 
 
 		 297 aa  45.8  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  27.13 
 
 		 296 aa  45.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  26.4 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  29.41 
 
 		 519 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  22.22 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>