73 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BTH_I0093  CDS  NC_007651  98679  99695  1017  hypothetical protein  YP_440653  decreased coverage  4.92521e-10  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I0142  CDS  NC_007651  171143  172291  1149  rod shape-determining protein RodA  YP_440700  decreased coverage  0.0099283  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I0715  CDS  NC_007651  823548  825065  1518  hypothetical protein  YP_441271  decreased coverage  0.0023847  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I0716  CDS  NC_007651  825092  826312  1221  cyclopropane fatty acid synthase family protein  YP_441272  decreased coverage  0.000471122  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I0717  CDS  NC_007651  826440  827237  798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  YP_441273  decreased coverage  9.6585e-05  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I0866  CDS  NC_007651  987031  987741  711  hypothetical protein  YP_441422  decreased coverage  0.00391209  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I1053  CDS  NC_007651  1195868  1196518  651  putative lipoprotein  YP_441607  decreased coverage  0.000833656  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I1056  CDS  NC_007651  1198682  1200823  2142  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  YP_441610  decreased coverage  0.00845594  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I1059  CDS  NC_007651  1202897  1203274  378  preprotein translocase subunit SecG  YP_441613  decreased coverage  0.000688057  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I1299  CDS  NC_007651  1456483  1459350  2868  bifunctional glutamine-synthetase adenylyltransferase/deadenyltransferase  YP_441846  decreased coverage  0.00650958  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I1300  CDS  NC_007651  1459598  1461247  1650  DNA repair protein RecN  YP_441847  decreased coverage  0.00383913  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I1301  CDS  NC_007651  1461278  1462177  900  NAD(+)/NADH kinase family protein  YP_441848  decreased coverage  0.00867601  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I1403  CDS  NC_007651  1579170  1580150  981  LysR family transcriptional regulator  YP_441949  decreased coverage  4.1163e-08  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I1504  CDS  NC_007651  1703258  1704565  1308  urea/short-chain amide ABC transporter, periplasmic urea/short-chain amide-binding protein  YP_442050  decreased coverage  0.00196796  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I1517  CDS  NC_007651  1717216  1718214  999  LysR family transcriptional regulator  YP_442062  decreased coverage  3.21062e-08  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I1518  CDS  NC_007651  1718255  1719286  1032  Sir2 family transcriptional regulator  YP_442063  decreased coverage  6.24517e-08  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I1707  CDS  NC_007651  1915474  1918680  3207  ribonuclease E  YP_442242  decreased coverage  0.000337375  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I1755  CDS  NC_007651  1963411  1964673  1263  ISBma3, transposase  YP_442287  decreased coverage  0.00342149  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I1838  CDS  NC_007651  2065457  2069599  4143  ATP-dependent helicase HrpA  YP_442369  decreased coverage  0.00763421  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I1979  CDS  NC_007651  2244773  2245885  1113  ABC transporter, permease protein  YP_442508  decreased coverage  4.94739e-09  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I1985  tRNA  NC_007651  2252742  2252817  76  tRNA-Ala    decreased coverage  5.6627e-12  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I1986  tRNA  NC_007651  2252968  2253043  76  tRNA-Glu    decreased coverage  5.34255e-12  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I1987  tRNA  NC_007651  2253121  2253197  77  tRNA-Asp    decreased coverage  4.48735e-12  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I1988  tRNA  NC_007651  2253262  2253337  76  tRNA-Glu    decreased coverage  4.80253e-12  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I2192  CDS  NC_007651  2466419  2467426  1008  glycosyl transferase, group 2 family protein  YP_442713  decreased coverage  2.5698e-05  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I2197  CDS  NC_007651  2471678  2472916  1239  aminotransferase AlaT  YP_442718  decreased coverage  1.41545e-08  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I2198  CDS  NC_007651  2472961  2474289  1329  homoserine dehydrogenase  YP_442719  decreased coverage  1.98219e-07  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I2253  CDS  NC_007651  2534047  2535222  1176  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  YP_442774  decreased coverage  0.00391915  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I2358  CDS  NC_007651  2656540  2657460  921  lipase/esterase  YP_442879  decreased coverage  0.00629855  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I2413  CDS  NC_007651  2747430  2748002  573  hypothetical protein  YP_442934  decreased coverage  0.000103288  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I2519  CDS  NC_007651  2872140  2874827  2688  ribonuclease R  YP_443038  decreased coverage  7.14577e-06  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I2566  CDS  NC_007651  2931198  2931659  462  hypothetical protein  YP_443083  decreased coverage  0.000987168  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I2567  CDS  NC_007651  2931964  2933472  1509  RNA pseudouridylate synthase family protein  YP_443084  decreased coverage  0.00446007  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I2662  CDS  NC_007651  3037643  3038863  1221  CAIB/BAIF family protein  YP_443177  decreased coverage  1.46578e-05  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I2757  CDS  NC_007651  3169373  3170389  1017  hypothetical protein  YP_443270  decreased coverage  0.00398439  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I2787  CDS  NC_007651  3202618  3204213  1596  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  YP_443299  decreased coverage  4.42386e-08  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I2813  CDS  NC_007651  3229715  3230437  723  hypothetical protein  YP_443325  decreased coverage  0.00156648  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I2859  CDS  NC_007651  3286416  3287012  597  AsnC family transcriptional regulator  YP_443371  decreased coverage  0.0033406  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I3054  CDS  NC_007651  3494470  3494865  396  30S ribosomal protein S8  YP_443558  decreased coverage  1.28186e-07  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I3055  CDS  NC_007651  3494880  3495185  306  30S ribosomal protein S14  YP_443559  decreased coverage  5.66724e-07  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I3068  CDS  NC_007651  3500846  3501505  660  50S ribosomal protein L3  YP_443572  decreased coverage  7.18216e-11  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I3088  CDS  NC_007651  3523033  3523584  552  putative transposase  YP_443588  decreased coverage  1.3802e-05  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I3309  CDS  NC_007651  3771091  3771966  876  F0F1 ATP synthase subunit gamma  YP_443801  decreased coverage  0.00792129  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_I3314  CDS  NC_007651  3775112  3775963  852  F0F1 ATP synthase subunit A  YP_443806  decreased coverage  0.000501735  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II0082  CDS  NC_007650  90537  91553  1017  hypothetical protein  YP_438284  decreased coverage  0.00626494  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II0315  CDS  NC_007650  384348  385253  906  transcriptional activator protein NhaR  YP_438516  decreased coverage  0.0037078  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II0318  CDS  NC_007650  386893  388368  1476  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  YP_438519  decreased coverage  0.000970405  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II0689  CDS  NC_007650  805233  806201  969  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  YP_438888  decreased coverage  0.000923213  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II0690  CDS  NC_007650  806188  807231  1044  GDP-mannose 4,6-dehydratase  YP_438889  decreased coverage  0.00490394  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II0829  CDS  NC_007650  970016  971242  1227  type III secretion system protein BsaP  YP_439026  decreased coverage  0.00319367  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1020  CDS  NC_007650  1204857  1204988  132  gp56-related protein  YP_439217  decreased coverage  0.00705208  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1021  CDS  NC_007650  1204999  1205274  276  gp49  YP_439218  decreased coverage  0.00587241  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1073  CDS  NC_007650  1249002  1250480  1479  betaine aldehyde dehydrogenase  YP_439270  decreased coverage  5.06243e-05  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1074  CDS  NC_007650  1250518  1251105  588  transcriptional regulator BetI  YP_439271  decreased coverage  2.26822e-05  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1075  CDS  NC_007650  1252103  1253002  900  rhamnosyltransferase 1, subunit A  YP_439272  decreased coverage  5.47934e-06  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1081  CDS  NC_007650  1258837  1260303  1467  multidrug resistance protein  YP_439278  decreased coverage  0.00767071  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1120  CDS  NC_007650  1301962  1302963  1002  LysR family transcriptional regulator  YP_439317  decreased coverage  0.00232816  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1121  CDS  NC_007650  1303179  1304012  834  hypothetical protein  YP_439318  decreased coverage  0.00170044  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1129  CDS  NC_007650  1311610  1312905  1296  amino acid permease  YP_439326  decreased coverage  0.00552424  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1130  CDS  NC_007650  1313250  1318130  4881  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  YP_439327  decreased coverage  0.00800963  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1173  CDS  NC_007650  1370919  1372379  1461  xylulokinase  YP_439370  decreased coverage  0.000934305  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1177  CDS  NC_007650  1375723  1376547  825  ABC transporter permease  YP_439374  decreased coverage  0.00800184  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1194  CDS  NC_007650  1398017  1399762  1746  potassium efflux system protein, putative  YP_439390  decreased coverage  0.0077476  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1353  CDS  NC_007650  1601855  1602910  1056  PBSX family phage portal protein  YP_439549  decreased coverage  0.00953251  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1382  CDS  NC_007650  1633527  1634531  1005  FecR family protein  YP_439578  decreased coverage  0.00451744  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1383  CDS  NC_007650  1634528  1635037  510  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  YP_439579  decreased coverage  0.00102713  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1386  CDS  NC_007650  1636480  1637292  813  hypothetical protein  YP_439582  decreased coverage  0.0048642  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1387  CDS  NC_007650  1637289  1637810  522  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  YP_439583  decreased coverage  0.00286946  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1509  CDS  NC_007650  1778325  1779041  717  MgtC family protein  YP_439705  decreased coverage  0.0099302  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II1881  CDS  NC_007650  2279278  2280177  900  rhamnosyltransferase 1, subunit A  YP_440075  decreased coverage  2.81436e-09  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II2003  CDS  NC_007650  2447973  2448641  669  transposon Tn2501 resolvase  YP_440197  decreased coverage  0.00181715  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II2179  CDS  NC_007650  2676032  2677795  1764  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_440367  decreased coverage  0.00530113  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
BTH_II2207  CDS  NC_007650  2711669  2711959  291  H-NS histone family protein  YP_440395  decreased coverage  1.44624e-11  n/a    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>