26 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
YPK_0358  CDS  NC_010465  383945  384064  +  120  hypothetical protein  YP_001719121  unclonable  0.000000000000372042  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_0841  CDS  NC_010465  962262  962969  -  708  deoxyribonuclease I  YP_001719595  unclonable  0.0000000000239428  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_1168  CDS  NC_010465  1306472  1307422  +  951  urea amidolyase related protein  YP_001719919  unclonable  0.000000000170574  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_1301  CDS  NC_010465  1430339  1431718  -  1380  exodeoxyribonuclease VII large subunit  YP_001720052  unclonable  0.00000000114365  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_1437  CDS  NC_010465  1586063  1587478  -  1416  glutamyl-tRNA synthetase  YP_001720183  unclonable  0.000000000838412  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_1677  CDS  NC_010465  1861843  1865493  -  3651  ribonuclease E  YP_001720423  unclonable  0.000377607  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_1686  CDS  NC_010465  1872294  1873028  +  735  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  YP_001720432  unclonable  0.0000000000234633  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_1854  CDS  NC_010465  2059668  2059904  -  237  LPP repeat-containing protein  YP_001720598  unclonable  0.000000000000796453  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_1873  CDS  NC_010465  2078508  2080145  -  1638  putative cell division protein  YP_001720617  unclonable  0.00000000430233  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_1874  CDS  NC_010465  2080193  2080558  +  366  hypothetical protein  YP_001720618  unclonable  0.00000000000160461  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_1875  CDS  NC_010465  2080690  2081586  +  897  aldo/keto reductase  YP_001720619  unclonable  0.0000000000512322  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_2469  CDS  NC_010465  2702505  2704811  -  2307  TonB-dependent siderophore receptor  YP_001721199  unclonable  0.000000279609  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_2629  CDS  NC_010465  2884883  2885389  +  507  SOS cell division inhibitor  YP_001721359  unclonable  0.00000000000371858  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_2630  CDS  NC_010465  2885747  2886808  +  1062  outer membrane protein A  YP_001721360  unclonable  0.000000000088038  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_3024  CDS  NC_010465  3326771  3327973  +  1203  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  YP_001721750  unclonable  0.000000000298829  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_3486  CDS  NC_010465  3827773  3828132  -  360  hypothetical protein  YP_001722206  unclonable  0.00000000000145157  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_3805  CDS  NC_010465  4193591  4194730  +  1140  iron-sulfur cluster binding protein  YP_001722525  unclonable  0.000000000182984  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_3807  CDS  NC_010465  4195435  4195833  +  399  hypothetical protein  YP_001722526  unclonable  0.00000000000487235  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_3929  CDS  NC_010465  4334105  4334638  -  534  protoporphyrinogen oxidase  YP_001722645  unclonable  0.00000000000339774  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_4072  CDS  NC_010465  4495923  4496786  -  864  glutamate racemase  YP_001722784  unclonable  0.0000000000383263  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_R0028  tRNA  NC_010465  3302900  3302976  +  77  tRNA-Met    unclonable  0.000000000000167131  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_R0048  tRNA  NC_010465  4195352  4195427  -  76  tRNA-Gly    unclonable  0.000000000000507488  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_R0049  tRNA  NC_010465  4195185  4195260  -  76  tRNA-Gly    unclonable  0.000000000000555538  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_R0050  tRNA  NC_010465  4195042  4195117  -  76  tRNA-Gly    unclonable  0.000000000000544411  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_R0054  tRNA  NC_010465  3698153  3698245  -  93  tRNA-Ser    unclonable  0.000000000000379646  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_R0090  rRNA  NC_010465  4332089  4333623  -  1535  16S ribosomal RNA    unclonable  0.00000000190898  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>