141 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
ECD_00027  CDS  CP001509  24887  25150  -  264  30S ribosomal protein S20  ACT41929  unclonable  0.000000413778  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00028  CDS  CP001509  25253  25471  +  219  hypothetical protein  ACT41930  unclonable  0.000000413778  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00029  CDS  CP001509  25479  26420  +  942  putative regulator  ACT41931  unclonable  0.00000173781  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00058  CDS  CP001509  58951  61305  -  2355  organic solvent tolerance protein precursor  ACT41959  unclonable  0.0000114767  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00059  CDS  CP001509  61560  62375  +  816  Dna-J like membrane chaperone protein  ACT41960  unclonable  0.000000486823  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00176  CDS  CP001509  203325  203810  +  486  periplasmic chaperone  ACT42077  unclonable  0.000000232591  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00177  CDS  CP001509  203814  204839  +  1026  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  ACT42078  unclonable  0.000000614586  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00178  CDS  CP001509  204944  205399  +  456  (3R)-hydroxymyristoyl ACP dehydratase  ACT42079  unclonable  0.000000281915  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00298  CDS  CP001509  332766  335840  -  3075  beta-D-galactosidase  ACT42197  unclonable  0.000026518  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00383  CDS  CP001509  418345  419292  -  948  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  ACT42282  unclonable  0.00000068734  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00384  CDS  CP001509  419754  421229  -  1476  muropeptide transporter  ACT42283  unclonable  0.00000202049  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00385  CDS  CP001509  421273  421851  -  579  predicted lipoprotein  ACT42284  unclonable  0.00000046254  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00386  CDS  CP001509  422156  422473  +  318  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  ACT42285  unclonable  0.000000327919  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00550  CDS  CP001509  570740  572980  -  2241  iron-enterobactin outer membrane transporter  ACT42429  unclonable  0.0000104738  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00631  CDS  CP001509  657387  659051  -  1665  asparagine synthetase B  ACT42507  unclonable  0.00000278776  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00644  CDS  CP001509  672861  673406  +  546  regulatory protein for replication initiation  ACT42520  unclonable  0.000000370073  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00702  CDS  CP001509  738259  739050  +  792  hypothetical protein  ACT42577  unclonable  0.000000422433  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00745  CDS  CP001509  796263  796940  +  678  dethiobiotin synthetase  ACT42646  unclonable  0.000000476961  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00950  CDS  CP001509  1011041  1011583  +  543  hypothetical protein  ACT42845  unclonable  0.000000481867  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00955  CDS  CP001509  1018348  1019988  +  1641  paraquat-inducible protein B  ACT42850  unclonable  0.00000262354  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00956  CDS  CP001509  1020000  1020548  +  549  hypothetical protein  ACT42851  unclonable  0.000000276204  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00957  CDS  CP001509  1020804  1020971  +  168  ribosome modulation factor  ACT42852  unclonable  0.000000113718  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00958  CDS  CP001509  1021041  1021559  -  519  3-hydroxydecanoyl-ACP dehydratase  ACT42853  unclonable  0.000000242251  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00959  CDS  CP001509  1021628  1023388  -  1761  predicted peptidase  ACT42854  unclonable  0.00000259682  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00960  CDS  CP001509  1023574  1024026  +  453  hypothetical protein  ACT42855  unclonable  0.000000190076  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00961  CDS  CP001509  1024102  1025142  -  1041  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  ACT42856  unclonable  0.00000050212  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01084  CDS  CP001509  1149361  1149882  +  522  hypothetical protein  ACT42979  unclonable  0.000000218944  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01085  CDS  CP001509  1149934  1150107  +  174  50S ribosomal protein L32  ACT42980  unclonable  0.000000124601  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01086  CDS  CP001509  1150188  1151258  +  1071  fatty acid/phospholipid synthesis protein  ACT42981  unclonable  0.000000639968  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01087  CDS  CP001509  1151326  1152279  +  954  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  ACT42982  unclonable  0.000000578388  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01088  CDS  CP001509  1152295  1153224  +  930  acyl carrier protein S-malonyltransferase  ACT42983  unclonable  0.000000737698  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01089  CDS  CP001509  1153237  1153971  +  735  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  ACT42984  unclonable  0.00000046254  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01090  CDS  CP001509  1154182  1154418  +  237  acyl carrier protein  ACT42985  unclonable  0.000000166866  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01159  CDS  CP001509  1219334  1220602  +  1269  DNA polymerase V subunit UmuC  ACT43051  unclonable  0.0000022565  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01160  CDS  CP001509  1220648  1221178  -  531  disulfide bond formation protein B  ACT43052  unclonable  0.000000659923  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01161  CDS  CP001509  1221324  1222865  -  1542  sodium/proton antiporter  ACT43053  unclonable  0.00000392786  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01162  CDS  CP001509  1223086  1223805  +  720  fatty acid metabolism regulator  ACT43054  unclonable  0.000000799515  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01163  CDS  CP001509  1223857  1225389  -  1533  hypothetical protein  ACT43055  unclonable  0.0000043482  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01257  CDS  CP001509  1326928  1328097  +  1170  hypothetical protein  ACT43145  unclonable  0.00000160117  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01499  CDS  CP001509  1577648  1578334  +  687  predicted DNA-binding transcriptional regulator  ACT43376  unclonable  0.000000422433  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01646  CDS  CP001509  1702690  1702926  +  237  murein lipoprotein  ACT43504  unclonable  0.000000290635  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01647  CDS  CP001509  1702990  1703994  -  1005  hypothetical protein  ACT43505  unclonable  0.00000143336  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01877  CDS  CP001509  1937410  1937958  -  549  phosphatidylglycerophosphate synthetase  ACT43731  unclonable  0.000000694411  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01878  CDS  CP001509  1938015  1939781  -  1767  excinuclease ABC subunit C  ACT43732  unclonable  0.00000583054  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01879  CDS  CP001509  1939844  1940353  -  510  response regulator  ACT43733  unclonable  0.000000614586  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01880  CDS  CP001509  1940475  1940750  +  276  IS1 protein InsA  ACT43734  unclonable  0.000000413778  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01881  CDS  CP001509  1940669  1941172  +  504  IS1 protein InsB  ACT43735  unclonable  0.000000653204  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01882  CDS  CP001509  1941174  1941833  +  660  chaperone protein HchA  ACT43736  unclonable  0.000000939788  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01883  CDS  CP001509  1941941  1943299  -  1359  predicted sensory kinase in two-component regulatory system with YedW  ACT43737  unclonable  0.00000273191  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01884  CDS  CP001509  1943299  1943970  -  672  predicted DNA-binding response regulator in two-component system with YedV  ACT43738  unclonable  0.000000533293  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01885  CDS  CP001509  1944103  1944516  +  414  hypothetical protein  ACT43739  unclonable  0.000000311781  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01886  CDS  CP001509  1944625  1945629  +  1005  hypothetical protein  ACT43740  unclonable  0.00000117188  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02224  CDS  CP001509  2305887  2306429  -  543  predicted NUDIX hydrolase  ACT44046  unclonable  0.000000212424  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02306  CDS  CP001509  2395794  2397209  -  1416  glutamyl-tRNA synthetase  ACT44127  unclonable  0.00000163468  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02307  CDS  CP001509  2397985  2398326  +  342  conserved hypothetical protein  ACT44128  unclonable  0.000000254731  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02308  CDS  CP001509  2398317  2399243  -  927  predicted DNA-binding transcriptional regulator  ACT44129  unclonable  0.000000841101  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02309  CDS  CP001509  2399333  2400331  +  999  predicted inner membrane protein  ACT44130  unclonable  0.000000832535  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02310  CDS  CP001509  2400328  2400546  -  219  hypothetical protein  ACT44131  unclonable  0.000000190076  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02311  CDS  CP001509  2400548  2402563  -  2016  NAD-dependent DNA ligase LigA  ACT44132  unclonable  0.00000571235  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02312  CDS  CP001509  2402634  2403620  -  987  cell division protein ZipA  ACT44133  unclonable  0.000000911583  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02313  CDS  CP001509  2403850  2404611  +  762  putative sulfate transport protein CysZ  ACT44134  unclonable  0.000000659923  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02314  CDS  CP001509  2404796  2405767  +  972  cysteine synthase A, O-acetylserine sulfhydrolase A subunit  ACT44135  unclonable  0.00000113698  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02315  CDS  CP001509  2406151  2406408  +  258  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase component of PTS system (Hpr)  ACT44136  unclonable  0.000000254731  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02316  CDS  CP001509  2406453  2408180  +  1728  PEP-protein phosphotransferase of PTS system (enzyme I)  ACT44137  unclonable  0.00000589054  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02401  CDS  CP001509  2498712  2500082  +  1371  exodeoxyribonuclease VII large subunit  ACT44221  unclonable  0.00000149221  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02482  CDS  CP001509  2598115  2600688  -  2574  protein disaggregation chaperone  ACT44301  unclonable  0.0000328184  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02621  CDS  CP001509  2736170  2737018  +  849  conserved hypothetical protein  ACT44438  unclonable  0.000000659923  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02622  CDS  CP001509  2737336  2738007  -  672  hypothetical protein  ACT44439  unclonable  0.000000486823  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02629  CDS  CP001509  2744006  2746240  -  2235  (p)ppGpp synthetase I/GTP pyrophosphokinase  ACT44446  unclonable  0.00000829976  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02740  CDS  CP001509  2884373  2885698  -  1326  proline aminopeptidase P II  ACT44557  unclonable  0.000000920962  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02741  CDS  CP001509  2885724  2886302  -  579  hypothetical protein  ACT44558  unclonable  0.000000279044  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02742  CDS  CP001509  2886470  2886799  +  330  cytokinetic ring-localizing protein  ACT44559  unclonable  0.000000149347  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02797  CDS  CP001509  2941476  2942360  +  885  integrase  ACT44614  unclonable  0.000000596142  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02798  CDS  CP001509  2942440  2943342  +  903  conserved hypothetical protein  ACT44615  unclonable  0.000000646552  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02811  CDS  CP001509  2943807  2944376  +  570  conserved hypothetical protein  ACT44616  unclonable  0.000000331292  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02812  CDS  CP001509  2944614  2944907  -  294  conserved hypothetical protein  ACT44617  unclonable  0.000000194006  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02813  CDS  CP001509  2945481  2945636  +  156  hypothetical protein  ACT44618  unclonable  0.000000204  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02814  CDS  CP001509  2945664  2946683  +  1020  conserved hypothetical protein  ACT44619  unclonable  0.000000939788  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02815  CDS  CP001509  2946767  2947903  +  1137  Capsule polysaccharide export inner-membrane protein kpsE  ACT44620  unclonable  0.00000139035  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02816  CDS  CP001509  2947927  2949603  +  1677  KpsD protein  ACT44621  unclonable  0.0000043482  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02817  CDS  CP001509  2949613  2950353  +  741  KpsU protein  ACT44622  unclonable  0.000000715728  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02818  CDS  CP001509  2950350  2952377  +  2028  Capsule polysaccharide export protein KpsC  ACT44623  unclonable  0.0000081315  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02819  CDS  CP001509  2952412  2953644  +  1233  KpsS protein  ACT44624  unclonable  0.00000140465  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02820  CDS  CP001509  2953898  2954830  -  933  hypothetical protein  ACT44625  unclonable  0.000000807741  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02821  CDS  CP001509  2954892  2956031  -  1140  hypothetical protein  ACT44626  unclonable  0.00000136217  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02822  CDS  CP001509  2956605  2957069  -  465  bifunctional Ribulose 5-phosphate reductase/CDP-ribitol pyrophosphorylase  ACT44627  unclonable  0.000000370073  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02823  CDS  CP001509  2957307  2957810  -  504  IS1 protein InsB  ACT44628  unclonable  0.000000374053  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02824  CDS  CP001509  2957729  2958004  -  276  IS1 protein InsA  ACT44629  unclonable  0.000000223419  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02825  CDS  CP001509  2958033  2958755  -  723  Pyrophosphorylase  ACT44630  unclonable  0.000000596142  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02826  CDS  CP001509  2958773  2960149  -  1377  hypothetical protein  ACT44631  unclonable  0.00000163468  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02827  CDS  CP001509  2960358  2961017  -  660  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  ACT44632  unclonable  0.000000422433  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02828  CDS  CP001509  2961032  2961808  -  777  Polysialic acid transport protein kpsM  ACT44633  unclonable  0.000000486823  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02829  CDS  CP001509  2962869  2963405  -  537  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  ACT44634  unclonable  0.00000034154  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02830    CP001509  2963407  2964267  -  861      unclonable  0.000000572498  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02831  CDS  CP001509  2964582  2965517  -  936  hypothetical type II secretion protein GspK  ACT44635  unclonable  0.000000902301  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02832  CDS  CP001509  2965556  2966119  -  564  hypothetical type II secretion protein GspJ  ACT44636  unclonable  0.00000053878  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02833  CDS  CP001509  2966158  2966529  -  372  hypothetical type II secretion protein  ACT44637  unclonable  0.000000311781  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02834  CDS  CP001509  2966526  2967089  -  564  GspH, hypothetical type II secretion protein  ACT44638  unclonable  0.000000472105  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02835  CDS  CP001509  2967093  2967548  -  456  hypothetical type II secretion protein GspG  ACT44639  unclonable  0.000000370073  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02836  CDS  CP001509  2967565  2968788  -  1224  hypothetical type II secretion protein GspF  ACT44640  unclonable  0.00000156909  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>