8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02830 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02830    100 
 
 		 861 bp  1707    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000572498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0727  general secretion pathway protein L  95.37 
 
 		 843 bp  1362    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3130  GspL-like protein  95.82 
 
 		 1179 bp  1421    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3419  GspL-like protein  95.7 
 
 		 1179 bp  1413    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3239  GspL-like protein  97.91 
 
 		 1179 bp  1564    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139825  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3404  GspL-like protein  95.12 
 
 		 1179 bp  1374    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02780    100 
 
 		 588 bp  1166    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000256539  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02779  hypothetical protein  100 
 
 		 273 bp  541  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000163075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>