13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0591 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0591  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  254  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0572  hypothetical protein  88 
 
 
125 aa  224  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  35.96 
 
 
154 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2102  hypothetical protein  32.98 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987971  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  34.38 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0561  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 
181 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106265  hitchhiker  0.00000244138 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  29.47 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  29.79 
 
 
176 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0180  RDD domain-containing protein  29.52 
 
 
217 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000223601  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0913  RDD domain-containing protein  28.57 
 
 
174 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0871904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2897  RDD domain-containing protein  29.09 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01858 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0168  hypothetical protein  31.07 
 
 
224 aa  41.6  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.225097  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2823  RDD domain-containing protein  31.25 
 
 
169 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.794501  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>