15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0572 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl0572  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  254  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0591  hypothetical protein  88 
 
 		 125 aa  224  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987971  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  35.64 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0561  RDD domain-containing protein  37.21 
 
 		 181 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106265  hitchhiker  0.00000244138 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  36.47 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  31.46 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  29.79 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0168  hypothetical protein  32.41 
 
 		 224 aa  41.6  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.225097  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  28.71 
 
 		 137 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  28.72 
 
 		 176 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0913  RDD domain-containing protein  27.68 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0871904  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0180  RDD domain-containing protein  32.52 
 
 		 217 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000223601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2823  RDD domain-containing protein  31.25 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.794501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2897  RDD domain-containing protein  28.18 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>