82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0305 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0305  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  336  9e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0289  hypothetical protein  98.75 
 
 
160 aa  331  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1138  hypothetical protein  27.21 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.558369  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2755  hypothetical protein  27.21 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2911  hypothetical protein  26.53 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0499229  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2604  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.15 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3548  hypothetical protein  27.27 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0312  hypothetical protein  24.83 
 
 
192 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00457617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4010  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.14 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0150  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.78 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0696937 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2456  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.97 
 
 
144 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.198045  normal  0.396382 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0497  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.46 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3911  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.43 
 
 
130 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0405  hypothetical protein  23.65 
 
 
143 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2892  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.22 
 
 
141 aa  52.4  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3564  hypothetical protein  25.81 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3057  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  22.45 
 
 
144 aa  51.2  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0815  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25 
 
 
136 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0332  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25 
 
 
213 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.989164  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0784  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0321  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.17 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.457074  hitchhiker  0.00769864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0761  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.81 
 
 
129 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6124  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.49 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430831  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1277  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.86 
 
 
130 aa  48.5  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0151455  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28950  hypothetical protein  25.71 
 
 
130 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.906248  hitchhiker  0.0000303722 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1578  hypothetical protein  28.44 
 
 
170 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.418396  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4408  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.95 
 
 
135 aa  47.8  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0696  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.97 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4252  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.8 
 
 
150 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4517  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.8 
 
 
150 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463989  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1655  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.43 
 
 
130 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290612  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4168  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.42 
 
 
133 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4052  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25 
 
 
130 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2568  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  23.97 
 
 
136 aa  47.4  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959618  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07594  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G15290)  27.78 
 
 
136 aa  47.4  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.651423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4001  hypothetical protein  25 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2817  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.21 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3816  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.17 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496132  normal  0.533485 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4770  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.81 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.251226  normal  0.268537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0334  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  24.81 
 
 
134 aa  46.6  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1429  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.32 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165331  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3089  hypothetical protein  25.17 
 
 
130 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2171  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1447  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.11 
 
 
136 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.724218  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1676  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.73 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0508744  hitchhiker  0.000321542 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1582  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  24.29 
 
 
135 aa  45.1  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.625923  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0878  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.65 
 
 
134 aa  44.7  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3908  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  21.83 
 
 
136 aa  44.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4979  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.37 
 
 
165 aa  44.3  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257887 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1327  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.43 
 
 
130 aa  44.3  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2194  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.27 
 
 
137 aa  44.3  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36194  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0450  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.05 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000104305  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0078  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.44 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3220  hypothetical protein  26.9 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3234  hypothetical protein  26.9 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3181  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.9 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0070  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.81 
 
 
123 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2062  hypothetical protein  26.9 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1928  hypothetical protein  26.9 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2681  hypothetical protein  26.9 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2092  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.2 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0175411  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0849  hypothetical protein  26.9 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1801  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  23.26 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  hitchhiker  0.00074845 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2827  putative lipoprotein  23.44 
 
 
139 aa  42.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0331828  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05940  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03180)  22.56 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3257  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.11 
 
 
131 aa  42  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158594  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7853  hypothetical protein  43.18 
 
 
80 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.648983  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5956  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  21.71 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.735238  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0763  hypothetical protein  24.24 
 
 
148 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3339  hypothetical protein  26.56 
 
 
137 aa  42  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3578  hypothetical protein  25.71 
 
 
126 aa  42  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0728656  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0381  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  22.14 
 
 
146 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.543361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6234  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24 
 
 
151 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.655235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2367  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  22.22 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703282  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2904  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  20.63 
 
 
140 aa  41.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  0.579092 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0916  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.78 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.403663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4618  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.82 
 
 
133 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1392  hypothetical protein  26.67 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0877  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3056  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.78 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00204984  hitchhiker  0.00341554 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3558  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  23.44 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2783  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  23.39 
 
 
133 aa  40.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0569406  hitchhiker  0.000528708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>