77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_4244 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4037  trans-2-enoyl-CoA reductase  80.15 
 
 		 398 aa  676    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4244  trans-2-enoyl-CoA reductase  100 
 
 		 399 aa  825    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4184  trans-2-enoyl-CoA reductase  100 
 
 		 399 aa  825    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000141661  normal  0.0392014 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3324  trans-2-enoyl-CoA reductase  81.36 
 
 		 400 aa  689    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0989549 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4815  trans-2-enoyl-CoA reductase  81.36 
 
 		 400 aa  684    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370443  normal  0.988841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5339  trans-2-enoyl-CoA reductase  81.11 
 
 		 400 aa  680    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4159  trans-2-enoyl-CoA reductase  99.25 
 
 		 399 aa  818    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00427096  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2211  trans-2-enoyl-CoA reductase  79.4 
 
 		 398 aa  668    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2012  trans-2-enoyl-CoA reductase  82.66 
 
 		 398 aa  692    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.224817 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5454  trans-2-enoyl-CoA reductase  81.36 
 
 		 400 aa  684    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.331485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25900  trans-2-enoyl-CoA reductase  79.4 
 
 		 398 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.852582  normal  0.0343266 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4797  trans-2-enoyl-CoA reductase  81.36 
 
 		 400 aa  683    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5407  trans-2-enoyl-CoA reductase  81.36 
 
 		 400 aa  684    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0197  trans-2-enoyl-CoA reductase  80.35 
 
 		 400 aa  673    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2198  trans-2-enoyl-CoA reductase  81.66 
 
 		 398 aa  685    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139454  decreased coverage  0.00257106 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1676  trans-2-enoyl-CoA reductase  77.39 
 
 		 397 aa  645    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.718328 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0885  trans-2-enoyl-CoA reductase  75.38 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0467  trans-2-enoyl-CoA reductase  75.13 
 
 		 397 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.442632  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1410  trans-2-enoyl-CoA reductase  75.38 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.47827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0692  trans-2-enoyl-CoA reductase  75.13 
 
 		 397 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.557968  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1619  trans-2-enoyl-CoA reductase  71.77 
 
 		 419 aa  608  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0778145  normal  0.27079 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2672  trans-2-enoyl-CoA reductase  76.38 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1626  trans-2-enoyl-CoA reductase  75.88 
 
 		 397 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1647  trans-2-enoyl-CoA reductase  75.63 
 
 		 397 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00688985  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1803  trans-2-enoyl-CoA reductase  75.63 
 
 		 397 aa  597  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2625  trans-2-enoyl-CoA reductase  60.56 
 
 		 395 aa  508  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.227051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02637  trans-2-enoyl-CoA reductase  59.75 
 
 		 400 aa  504  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003764  short-chain alcohol dehydrogenase family  59.49 
 
 		 400 aa  504  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000232821  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1949  trans-2-enoyl-CoA reductase  60.15 
 
 		 399 aa  502  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0228965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2865  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.76 
 
 		 400 aa  481  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164104  hitchhiker  0.0000212201 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0713  trans-2-enoyl-CoA reductase  58.33 
 
 		 396 aa  482  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2273  trans-2-enoyl-CoA reductase  56.82 
 
 		 395 aa  480  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0610  trans-2-enoyl-CoA reductase  56.39 
 
 		 400 aa  477  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.631459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3891  trans-2-enoyl-CoA reductase  56.85 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405342  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3107  trans-2-enoyl-CoA reductase  58.33 
 
 		 400 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0855236  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1599  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.32 
 
 		 400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0927316  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1633  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.32 
 
 		 400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1495  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.32 
 
 		 401 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0451  trans-2-enoyl-CoA reductase  56.96 
 
 		 393 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.751407  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2557  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.32 
 
 		 400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.171639  normal  0.0679206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1230  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.36 
 
 		 400 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2655  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.32 
 
 		 400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.108492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1547  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.61 
 
 		 400 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258861  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2744  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.07 
 
 		 400 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0871249  normal  0.406128 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2489  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.07 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.753328  normal  0.0117707 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1339  trans-2-enoyl-CoA reductase  58.59 
 
 		 401 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.449883  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2487  trans-2-enoyl-CoA reductase  56.85 
 
 		 400 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1610  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.07 
 
 		 400 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4621  trans-2-enoyl-CoA reductase  58.84 
 
 		 403 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0615239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2585  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.11 
 
 		 400 aa  464  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323374  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2676  trans-2-enoyl-CoA reductase  56.57 
 
 		 400 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.325835  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2503  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.58 
 
 		 400 aa  464  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.214171  normal  0.292371 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1800  trans-2-enoyl-CoA reductase  56.57 
 
 		 400 aa  463  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1071  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.04 
 
 		 396 aa  462  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4635  trans-2-enoyl-CoA reductase  59.09 
 
 		 403 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00744  trans-2-enoyl-CoA reductase  56.96 
 
 		 392 aa  459  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2028  trans-2-enoyl-CoA reductase  59.09 
 
 		 400 aa  458  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123879  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4497  trans-2-enoyl-CoA reductase  58.84 
 
 		 403 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03458  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.04 
 
 		 405 aa  457  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2823  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.93 
 
 		 405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1096  trans-2-enoyl-CoA reductase  56.46 
 
 		 424 aa  448  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337214  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1188  trans-2-enoyl-CoA reductase  56.46 
 
 		 424 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2275  trans-2-enoyl-CoA reductase  55.89 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00154098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3464  trans-2-enoyl-CoA reductase  55.92 
 
 		 396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.157002  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0804  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.83 
 
 		 399 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.660681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0369  trans-2-enoyl-CoA reductase  51.76 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.00000000000000139547  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1824  trans-2-enoyl-CoA reductase  51.51 
 
 		 406 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000451148  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1286  trans-2-enoyl-CoA reductase  51.03 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215351  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2744  Trans-2-enoyl-CoA reductase (NAD(+))  50.64 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000936186  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2045  trans-2-enoyl-CoA reductase  48.71 
 
 		 389 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2331  trans-2-enoyl-CoA reductase  48.97 
 
 		 389 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273169  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0597  trans-2-enoyl-CoA reductase  47.34 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05803  trans-2-enoyl-CoA reductase  46.43 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0725  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.82 
 
 		 402 aa  335  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000102054  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1267  Trans-2-enoyl-CoA reductase (NAD(+))  42.56 
 
 		 392 aa  333  3e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000338569  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3538  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.94 
 
 		 400 aa  329  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000169  uncharacterized paraquat-inducible protein B  44.76 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>