77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3538 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3538  trans-2-enoyl-CoA reductase  100 
 
 		 400 aa  825    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05803  trans-2-enoyl-CoA reductase  60.75 
 
 		 399 aa  501  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000169  uncharacterized paraquat-inducible protein B  60.5 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0725  trans-2-enoyl-CoA reductase  56.64 
 
 		 402 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000102054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2744  Trans-2-enoyl-CoA reductase (NAD(+))  54.16 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000936186  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1071  trans-2-enoyl-CoA reductase  50.13 
 
 		 396 aa  378  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3464  trans-2-enoyl-CoA reductase  49.48 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.157002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2275  trans-2-enoyl-CoA reductase  50.51 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00154098 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0597  trans-2-enoyl-CoA reductase  48.13 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2625  trans-2-enoyl-CoA reductase  48.62 
 
 		 395 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.227051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003764  short-chain alcohol dehydrogenase family  48.21 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000232821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2273  trans-2-enoyl-CoA reductase  47.72 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02637  trans-2-enoyl-CoA reductase  47.96 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2331  trans-2-enoyl-CoA reductase  47.34 
 
 		 389 aa  358  9e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273169  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1949  trans-2-enoyl-CoA reductase  47.61 
 
 		 399 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0228965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2865  trans-2-enoyl-CoA reductase  46.94 
 
 		 400 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164104  hitchhiker  0.0000212201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0610  trans-2-enoyl-CoA reductase  46.75 
 
 		 400 aa  354  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.631459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0369  trans-2-enoyl-CoA reductase  46.7 
 
 		 406 aa  353  4e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.00000000000000139547  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1824  trans-2-enoyl-CoA reductase  46.45 
 
 		 406 aa  352  7e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000451148  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2045  trans-2-enoyl-CoA reductase  46.33 
 
 		 389 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03458  trans-2-enoyl-CoA reductase  47.1 
 
 		 405 aa  350  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2012  trans-2-enoyl-CoA reductase  47.84 
 
 		 398 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.224817 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00744  trans-2-enoyl-CoA reductase  46.04 
 
 		 392 aa  347  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0451  trans-2-enoyl-CoA reductase  44.96 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.751407  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2198  trans-2-enoyl-CoA reductase  47.58 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139454  decreased coverage  0.00257106 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1188  trans-2-enoyl-CoA reductase  46.94 
 
 		 424 aa  345  6e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1096  trans-2-enoyl-CoA reductase  46.68 
 
 		 424 aa  345  7e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3107  trans-2-enoyl-CoA reductase  46.43 
 
 		 400 aa  345  8e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0855236  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1230  trans-2-enoyl-CoA reductase  46.94 
 
 		 400 aa  343  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3324  trans-2-enoyl-CoA reductase  48.22 
 
 		 400 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0989549 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3891  trans-2-enoyl-CoA reductase  46.68 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405342  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4815  trans-2-enoyl-CoA reductase  47.21 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370443  normal  0.988841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5407  trans-2-enoyl-CoA reductase  47.21 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4797  trans-2-enoyl-CoA reductase  47.21 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5454  trans-2-enoyl-CoA reductase  47.21 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.331485 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2585  trans-2-enoyl-CoA reductase  46.94 
 
 		 400 aa  339  5e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323374  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2211  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.29 
 
 		 398 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2028  trans-2-enoyl-CoA reductase  47.11 
 
 		 400 aa  339  5.9999999999999996e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123879  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2676  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.41 
 
 		 400 aa  338  7e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.325835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1547  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.41 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258861  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25900  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.04 
 
 		 398 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.852582  normal  0.0343266 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1619  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.26 
 
 		 419 aa  336  3.9999999999999995e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0778145  normal  0.27079 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5339  trans-2-enoyl-CoA reductase  46.7 
 
 		 400 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2487  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.41 
 
 		 400 aa  334  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0197  trans-2-enoyl-CoA reductase  47.21 
 
 		 400 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2744  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.66 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0871249  normal  0.406128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1610  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.66 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1599  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.41 
 
 		 400 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0927316  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1633  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.41 
 
 		 400 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2489  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.92 
 
 		 400 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.753328  normal  0.0117707 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2557  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.92 
 
 		 400 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.171639  normal  0.0679206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2503  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.66 
 
 		 400 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.214171  normal  0.292371 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2655  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.92 
 
 		 400 aa  332  9e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.108492  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1800  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.41 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1339  trans-2-enoyl-CoA reductase  48.21 
 
 		 401 aa  330  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.449883  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4159  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.94 
 
 		 399 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00427096  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1267  Trans-2-enoyl-CoA reductase (NAD(+))  43.37 
 
 		 392 aa  329  4e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000338569  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4244  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.94 
 
 		 399 aa  329  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4184  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.94 
 
 		 399 aa  329  4e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000141661  normal  0.0392014 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1495  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.15 
 
 		 401 aa  330  4e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4621  trans-2-enoyl-CoA reductase  44.67 
 
 		 403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0615239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4635  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.18 
 
 		 403 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2823  trans-2-enoyl-CoA reductase  44.84 
 
 		 405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4497  trans-2-enoyl-CoA reductase  44.92 
 
 		 403 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1676  trans-2-enoyl-CoA reductase  44.76 
 
 		 397 aa  320  3e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.718328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0804  trans-2-enoyl-CoA reductase  44.1 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.660681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1410  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.15 
 
 		 397 aa  316  6e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.47827  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0885  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.15 
 
 		 397 aa  316  6e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1286  trans-2-enoyl-CoA reductase  44.39 
 
 		 386 aa  315  7e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215351  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0692  trans-2-enoyl-CoA reductase  44.9 
 
 		 397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.557968  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0467  trans-2-enoyl-CoA reductase  44.9 
 
 		 397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.442632  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0713  trans-2-enoyl-CoA reductase  43.08 
 
 		 396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4037  trans-2-enoyl-CoA reductase  44.02 
 
 		 398 aa  312  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2672  trans-2-enoyl-CoA reductase  46.43 
 
 		 397 aa  309  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1626  trans-2-enoyl-CoA reductase  44.76 
 
 		 397 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1647  trans-2-enoyl-CoA reductase  44.76 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00688985  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1803  trans-2-enoyl-CoA reductase  44.76 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>