77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2744 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1547  trans-2-enoyl-CoA reductase  85.89 
 
 
400 aa  696    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258861  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1610  trans-2-enoyl-CoA reductase  100 
 
 
400 aa  829    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2503  trans-2-enoyl-CoA reductase  86.65 
 
 
400 aa  705    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.214171  normal  0.292371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1495  trans-2-enoyl-CoA reductase  96.75 
 
 
401 aa  786    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0610  trans-2-enoyl-CoA reductase  74.5 
 
 
400 aa  651    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.631459  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1230  trans-2-enoyl-CoA reductase  88 
 
 
400 aa  716    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2655  trans-2-enoyl-CoA reductase  95.5 
 
 
400 aa  780    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.108492  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003764  short-chain alcohol dehydrogenase family  81.75 
 
 
400 aa  698    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000232821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1339  trans-2-enoyl-CoA reductase  83.5 
 
 
401 aa  672    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.449883  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2865  trans-2-enoyl-CoA reductase  73.75 
 
 
400 aa  634    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164104  hitchhiker  0.0000212201 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2585  trans-2-enoyl-CoA reductase  87.25 
 
 
400 aa  719    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323374  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2557  trans-2-enoyl-CoA reductase  95.75 
 
 
400 aa  782    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.171639  normal  0.0679206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2489  trans-2-enoyl-CoA reductase  95 
 
 
400 aa  778    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.753328  normal  0.0117707 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1599  trans-2-enoyl-CoA reductase  99.75 
 
 
400 aa  828    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0927316  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02637  trans-2-enoyl-CoA reductase  81.25 
 
 
400 aa  695    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2676  trans-2-enoyl-CoA reductase  88.5 
 
 
400 aa  732    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.325835  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2487  trans-2-enoyl-CoA reductase  90 
 
 
400 aa  740    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1633  trans-2-enoyl-CoA reductase  99.75 
 
 
400 aa  828    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.600217  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3107  trans-2-enoyl-CoA reductase  87.41 
 
 
400 aa  707    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0855236  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1800  trans-2-enoyl-CoA reductase  96 
 
 
400 aa  784    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2028  trans-2-enoyl-CoA reductase  82.25 
 
 
400 aa  654    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123879  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2744  trans-2-enoyl-CoA reductase  100 
 
 
400 aa  829    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0871249  normal  0.406128 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1949  trans-2-enoyl-CoA reductase  70 
 
 
399 aa  611  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0228965 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03458  trans-2-enoyl-CoA reductase  71.04 
 
 
405 aa  599  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2823  trans-2-enoyl-CoA reductase  71.85 
 
 
405 aa  595  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4621  trans-2-enoyl-CoA reductase  68.58 
 
 
403 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0615239  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1188  trans-2-enoyl-CoA reductase  67.83 
 
 
424 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1096  trans-2-enoyl-CoA reductase  67.83 
 
 
424 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337214  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4635  trans-2-enoyl-CoA reductase  68.33 
 
 
403 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0804  trans-2-enoyl-CoA reductase  69.25 
 
 
399 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.660681  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4497  trans-2-enoyl-CoA reductase  68.08 
 
 
403 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859119  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2625  trans-2-enoyl-CoA reductase  60.96 
 
 
395 aa  511  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.227051  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3324  trans-2-enoyl-CoA reductase  60 
 
 
400 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0989549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2012  trans-2-enoyl-CoA reductase  58.73 
 
 
398 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.224817 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2198  trans-2-enoyl-CoA reductase  58.48 
 
 
398 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139454  decreased coverage  0.00257106 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0197  trans-2-enoyl-CoA reductase  59.49 
 
 
400 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4797  trans-2-enoyl-CoA reductase  58.73 
 
 
400 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4815  trans-2-enoyl-CoA reductase  58.73 
 
 
400 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370443  normal  0.988841 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5454  trans-2-enoyl-CoA reductase  58.73 
 
 
400 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.331485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5407  trans-2-enoyl-CoA reductase  58.73 
 
 
400 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5339  trans-2-enoyl-CoA reductase  58.48 
 
 
400 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254325  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25900  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.47 
 
 
398 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.852582  normal  0.0343266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2211  trans-2-enoyl-CoA reductase  56.96 
 
 
398 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4037  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.51 
 
 
398 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1619  trans-2-enoyl-CoA reductase  56.17 
 
 
419 aa  492  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0778145  normal  0.27079 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1676  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.51 
 
 
397 aa  489  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.718328 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4184  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.07 
 
 
399 aa  485  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000141661  normal  0.0392014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4244  trans-2-enoyl-CoA reductase  57.07 
 
 
399 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4159  trans-2-enoyl-CoA reductase  56.82 
 
 
399 aa  481  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00427096  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3891  trans-2-enoyl-CoA reductase  55.47 
 
 
394 aa  477  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405342  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1071  trans-2-enoyl-CoA reductase  55.3 
 
 
396 aa  464  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0885  trans-2-enoyl-CoA reductase  55.44 
 
 
397 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1410  trans-2-enoyl-CoA reductase  55.44 
 
 
397 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.47827  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0713  trans-2-enoyl-CoA reductase  56.57 
 
 
396 aa  459  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0467  trans-2-enoyl-CoA reductase  55.19 
 
 
397 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.442632  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0692  trans-2-enoyl-CoA reductase  55.19 
 
 
397 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.557968  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2273  trans-2-enoyl-CoA reductase  54.87 
 
 
395 aa  456  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0451  trans-2-enoyl-CoA reductase  55.05 
 
 
393 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.751407  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00744  trans-2-enoyl-CoA reductase  55.44 
 
 
392 aa  455  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3464  trans-2-enoyl-CoA reductase  53.88 
 
 
396 aa  451  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.157002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1626  trans-2-enoyl-CoA reductase  55.95 
 
 
397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1647  trans-2-enoyl-CoA reductase  55.7 
 
 
397 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00688985  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1803  trans-2-enoyl-CoA reductase  55.7 
 
 
397 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2672  trans-2-enoyl-CoA reductase  55.7 
 
 
397 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2275  trans-2-enoyl-CoA reductase  53.54 
 
 
397 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00154098 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0369  trans-2-enoyl-CoA reductase  51.41 
 
 
406 aa  425  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.00000000000000139547  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1824  trans-2-enoyl-CoA reductase  51.41 
 
 
406 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000451148  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2331  trans-2-enoyl-CoA reductase  51.28 
 
 
389 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273169  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2045  trans-2-enoyl-CoA reductase  50.77 
 
 
389 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0597  trans-2-enoyl-CoA reductase  51.64 
 
 
397 aa  397  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1286  trans-2-enoyl-CoA reductase  49.61 
 
 
386 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215351  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2744  Trans-2-enoyl-CoA reductase (NAD(+))  47.7 
 
 
397 aa  368  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000936186  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1267  Trans-2-enoyl-CoA reductase (NAD(+))  45.15 
 
 
392 aa  366  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000338569  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3538  trans-2-enoyl-CoA reductase  45.66 
 
 
400 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05803  trans-2-enoyl-CoA reductase  42.86 
 
 
399 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000169  uncharacterized paraquat-inducible protein B  42.86 
 
 
399 aa  333  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0725  trans-2-enoyl-CoA reductase  42.68 
 
 
402 aa  332  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000102054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>